159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1117 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  100 
 
 		 324 aa  637    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  53.65 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  42.14 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.14 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  42.31 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  36.25 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  35.44 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  35.01 
 
 		 339 aa  158  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  36.84 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  36.89 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  31.83 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  35.03 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  37.46 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  32.3 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  31.45 
 
 		 312 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  30.03 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  30.99 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  32.53 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  31.23 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  32.81 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  32.81 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  32.81 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  30.28 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  33.02 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  33.56 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  32.91 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  32.99 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  30.16 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  32.2 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  28.26 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  29.75 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  25.62 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  27.83 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  30.18 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  29.75 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  30.5 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  26.06 
 
 		 324 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  29.69 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  25.99 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  27.33 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  30.8 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  26.96 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  29.04 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  25.97 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  28.34 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  24.36 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  27.65 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  25.41 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  27.27 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  23.64 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  24.75 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  25.8 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  27.72 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  26.8 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  26.38 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  25 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  25.15 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  24.48 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  25.57 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  30.66 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  26.01 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  28.93 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  26.12 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  23.99 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  26.2 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  23.85 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  26.2 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  26.32 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  29.54 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  26.51 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  24.58 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  24.6 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  26.49 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  22.67 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  26.45 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  24.67 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  26.32 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  27.69 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  26.07 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  25.37 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  25.96 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  28.34 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  24.66 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  23.29 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  23.29 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  23.29 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  23.51 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  27.37 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  25.52 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  23.61 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  24.4 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  24.14 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  22.07 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  31.33 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  23 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  24.76 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  26.23 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  22.41 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  25.24 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  22.07 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>