More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0004 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  100 
 
 
375 aa  767  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  100 
 
 
375 aa  767  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  99.47 
 
 
375 aa  763  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  95.99 
 
 
373 aa  733  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  96.79 
 
 
375 aa  746  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  100 
 
 
375 aa  767  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  99.73 
 
 
375 aa  763  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  98.93 
 
 
375 aa  762  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  99.73 
 
 
375 aa  765  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  99.73 
 
 
375 aa  765  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  99.73 
 
 
375 aa  765  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  67.2 
 
 
374 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  65.76 
 
 
372 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  55.65 
 
 
370 aa  418  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  55.65 
 
 
370 aa  418  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  56.1 
 
 
371 aa  415  1e-115  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  50.94 
 
 
374 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  49.6 
 
 
374 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  48.4 
 
 
374 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  48.52 
 
 
373 aa  359  5e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  47.73 
 
 
369 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  49.46 
 
 
359 aa  331  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  46.47 
 
 
366 aa  328  8e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  44.17 
 
 
375 aa  308  1e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  45.36 
 
 
386 aa  305  8e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  42.32 
 
 
361 aa  305  1e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  42.32 
 
 
361 aa  305  1e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.55 
 
 
371 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.89 
 
 
360 aa  289  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  42.23 
 
 
369 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  40.71 
 
 
371 aa  273  2e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  37.3 
 
 
371 aa  263  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.11 
 
 
372 aa  262  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  38.34 
 
 
364 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.11 
 
 
376 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  40.8 
 
 
365 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  38.71 
 
 
376 aa  245  1e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  36.18 
 
 
392 aa  244  2e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  38.48 
 
 
384 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  34.15 
 
 
365 aa  240  3e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  32.79 
 
 
365 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  35.16 
 
 
370 aa  229  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  37.03 
 
 
362 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.07 
 
 
360 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  36.99 
 
 
386 aa  226  5e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  35.23 
 
 
364 aa  225  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.69 
 
 
364 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  34.78 
 
 
398 aa  223  5e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  35.22 
 
 
390 aa  221  1e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  35.49 
 
 
369 aa  221  2e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  37.57 
 
 
380 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  37.57 
 
 
380 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  33.87 
 
 
370 aa  213  3e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  35 
 
 
377 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.99 
 
 
382 aa  210  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.98 
 
 
362 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.15018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  37.94 
 
 
377 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.61 
 
 
397 aa  206  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  30.5 
 
 
402 aa  205  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  29.9 
 
 
401 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.03 
 
 
377 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  32.66 
 
 
401 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  32.35 
 
 
371 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  34.88 
 
 
363 aa  201  2e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  35.55 
 
 
385 aa  201  2e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.14 
 
 
397 aa  201  2e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  32.01 
 
 
371 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  33.85 
 
 
394 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.7 
 
 
374 aa  199  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.77 
 
 
363 aa  199  1e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  31.56 
 
 
387 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.77 
 
 
370 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  31.89 
 
 
390 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  3.32989e-05  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  37.03 
 
 
352 aa  197  4e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  35.29 
 
 
387 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.38 
 
 
390 aa  195  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.54 
 
 
359 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.23 
 
 
415 aa  193  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  9.51254e-07  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.9 
 
 
398 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  35.38 
 
 
348 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.23 
 
 
399 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.43 
 
 
369 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  35.21 
 
 
348 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  31.47 
 
 
386 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.22 
 
 
414 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  34.23 
 
 
365 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  30.13 
 
 
399 aa  191  3e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  31.73 
 
 
377 aa  190  3e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  28.77 
 
 
404 aa  189  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  28.79 
 
 
390 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  30.45 
 
 
380 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.38 
 
 
365 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  30.45 
 
 
380 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  30.45 
 
 
380 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.23 
 
 
378 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  31.71 
 
 
360 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.69 
 
 
380 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  31.73 
 
 
376 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  1.75389e-08 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.33 
 
 
381 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.91 
 
 
358 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>