More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6187 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.91 
 
 		 532 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  100 
 
 		 529 aa  1072    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  78.11 
 
 		 530 aa  852    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.57 
 
 		 528 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  61.15 
 
 		 525 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.09 
 
 		 528 aa  821    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.1 
 
 		 529 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  76.17 
 
 		 531 aa  815    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  63.24 
 
 		 522 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  76.55 
 
 		 528 aa  818    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.7 
 
 		 525 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  62.7 
 
 		 525 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.38 
 
 		 532 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58 
 
 		 532 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.59 
 
 		 525 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.22 
 
 		 529 aa  618  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.41 
 
 		 529 aa  617  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  56.73 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.01 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.43 
 
 		 529 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.18 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.16 
 
 		 543 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.33 
 
 		 516 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.07 
 
 		 536 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  48.33 
 
 		 508 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.69 
 
 		 530 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.76 
 
 		 517 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.82 
 
 		 524 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.63 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.82 
 
 		 524 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.63 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44 
 
 		 526 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.45 
 
 		 524 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.45 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44 
 
 		 523 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.78 
 
 		 524 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.91 
 
 		 516 aa  415  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  43.68 
 
 		 523 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.1 
 
 		 532 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.16 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.6 
 
 		 512 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  39.31 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 		 517 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  36.35 
 
 		 519 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.52 
 
 		 510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.56 
 
 		 516 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.87 
 
 		 513 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  35.59 
 
 		 534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 539 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  36.29 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.38 
 
 		 516 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.63 
 
 		 526 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 		 542 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.98 
 
 		 542 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  39.88 
 
 		 532 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 		 535 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.61 
 
 		 542 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.61 
 
 		 542 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.33 
 
 		 532 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.85 
 
 		 543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.15 
 
 		 535 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.62 
 
 		 539 aa  312  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.79 
 
 		 519 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 		 536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.25 
 
 		 540 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.05 
 
 		 538 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 		 523 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 		 526 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 		 539 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.76 
 
 		 529 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.58 
 
 		 529 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.46 
 
 		 527 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  34.19 
 
 		 524 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 		 516 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.15 
 
 		 532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 		 515 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 523 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.56 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 		 537 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_00460  transport protein  32.46 
 
 		 528 aa  277  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.67 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.29 
 
 		 526 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.79 
 
 		 506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.35 
 
 		 524 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.09 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 530 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 		 529 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 		 517 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 528 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 528 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 528 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 517 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.16 
 
 		 515 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.75 
 
 		 527 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
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NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.76 
 
 		 532 aa  267  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
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