More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3350 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  100 
 
 		 276 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  49.6 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  46.79 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  54.15 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  62.5 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  54.26 
 
 		 197 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  47.3 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  52.36 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  48.9 
 
 		 241 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  53.77 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  53.3 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  54.87 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  55.14 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  51.13 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  48.74 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  68.46 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  66.41 
 
 		 300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  57.06 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  66.15 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  62.14 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  66.14 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  63.93 
 
 		 233 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  60.77 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  62.41 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  62.41 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  58 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  51.94 
 
 		 217 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  54.6 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  51.16 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  60.94 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  44.8 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  47.4 
 
 		 460 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  64.91 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  49.32 
 
 		 484 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  50.38 
 
 		 439 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  47.44 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  50.87 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  49.36 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  49.69 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  51.97 
 
 		 210 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  69.23 
 
 		 120 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  42.33 
 
 		 199 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  43.61 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  52.21 
 
 		 438 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 196 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  43.31 
 
 		 174 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  45.38 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  43.08 
 
 		 207 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 260 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  44.8 
 
 		 204 aa  85.9  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  34.25 
 
 		 191 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  43.9 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  44.17 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  41.86 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  45 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  34.13 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.54 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  38.78 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  45 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  41.54 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  41.54 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  43.8 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  41.27 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  43.55 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  40.29 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  36.99 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  42.37 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  42.48 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40.8 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.2 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  48.21 
 
 		 202 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  43.41 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  40.41 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.37 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  42.5 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  40.65 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  37.59 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  43.1 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  43.9 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  42.5 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  39.68 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  43.1 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  42.19 
 
 		 716 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.97 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  33.57 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  36.05 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 		 175 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.52 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  41.67 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  39.42 
 
 		 643 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  46.43 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  42.02 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>