More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0014 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  100 
 
 
460 aa  878  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  58.57 
 
 
470 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  56.98 
 
 
470 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  56.83 
 
 
474 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  56.4 
 
 
469 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  38.94 
 
 
471 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  39.11 
 
 
471 aa  296  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  39.11 
 
 
470 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  36.61 
 
 
465 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  38.6 
 
 
467 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  37.77 
 
 
460 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  39.78 
 
 
467 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  38.5 
 
 
470 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  38.94 
 
 
472 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  38.41 
 
 
472 aa  259  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  38.62 
 
 
470 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  38.94 
 
 
472 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  38.37 
 
 
458 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  38.39 
 
 
470 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  39.08 
 
 
460 aa  256  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  39.09 
 
 
477 aa  256  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  40.1 
 
 
467 aa  254  2e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  38.06 
 
 
462 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  39.26 
 
 
468 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  38.32 
 
 
472 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  38.39 
 
 
468 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.51457e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  38.8 
 
 
451 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  37.84 
 
 
462 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  37.84 
 
 
462 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  37.67 
 
 
462 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  37.67 
 
 
462 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  37.67 
 
 
462 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  38.57 
 
 
451 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  38.18 
 
 
467 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  38.39 
 
 
464 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  38.17 
 
 
468 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  38.17 
 
 
468 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  38.17 
 
 
468 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  38.17 
 
 
468 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  38.17 
 
 
468 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  37.61 
 
 
463 aa  247  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  37.61 
 
 
462 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  37.77 
 
 
477 aa  245  1e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  38.41 
 
 
453 aa  245  1e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  37.61 
 
 
456 aa  244  2e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  37.86 
 
 
468 aa  244  2e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  38.55 
 
 
490 aa  233  4e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  37.36 
 
 
462 aa  233  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  36.18 
 
 
460 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  37.05 
 
 
460 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  36.41 
 
 
464 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  38.64 
 
 
461 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  31.31 
 
 
457 aa  221  1e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  35.7 
 
 
466 aa  215  1e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  30.8 
 
 
457 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.19244e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  35.23 
 
 
462 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  30.8 
 
 
457 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  30.8 
 
 
457 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  35.83 
 
 
462 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  34.16 
 
 
442 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  30.38 
 
 
458 aa  206  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  6.31963e-06 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  35.45 
 
 
462 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  30.67 
 
 
460 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  34.82 
 
 
463 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  29.6 
 
 
462 aa  204  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  36.41 
 
 
488 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  35.45 
 
 
462 aa  202  1e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  35.23 
 
 
462 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  31.91 
 
 
457 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  31.63 
 
 
464 aa  198  2e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  2.88761e-05  decreased coverage  4.85587e-08 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.08 
 
 
466 aa  198  2e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2428  multidrug resistance protein NorM, putative  31.07 
 
 
446 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00757728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  28.38 
 
 
454 aa  197  4e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  28.86 
 
 
452 aa  197  5e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  28.38 
 
 
453 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  29.91 
 
 
452 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  28.38 
 
 
453 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  28.38 
 
 
453 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  32.02 
 
 
480 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  28.38 
 
 
453 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  28.73 
 
 
460 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  29.52 
 
 
452 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  30.25 
 
 
455 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  37.24 
 
 
451 aa  191  3e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  31.98 
 
 
457 aa  191  3e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  28.38 
 
 
453 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  28.38 
 
 
453 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  31.77 
 
 
464 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  28.79 
 
 
452 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  30.43 
 
 
457 aa  187  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  27.68 
 
 
457 aa  187  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  29.73 
 
 
457 aa  185  1e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  29.98 
 
 
457 aa  185  1e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  30.28 
 
 
457 aa  184  2e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.09014e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  30.28 
 
 
457 aa  184  2e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  2.67108e-06 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  28.85 
 
 
461 aa  185  2e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  31.53 
 
 
477 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  1.29498e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  29.75 
 
 
457 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.68736e-06  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  30.28 
 
 
457 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  29.02 
 
 
457 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>