More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31220 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
308 aa  623  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  74.92 
 
 
307 aa  474  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  63.36 
 
 
313 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  62.89 
 
 
311 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  60.34 
 
 
305 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  56.95 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  61.17 
 
 
314 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  56.61 
 
 
304 aa  348  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  57.09 
 
 
306 aa  346  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  56.27 
 
 
304 aa  346  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  53.87 
 
 
300 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  59.6 
 
 
309 aa  343  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  58.68 
 
 
303 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  55.86 
 
 
320 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  59.6 
 
 
309 aa  342  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0722  LysR family transcriptional regulator  60.63 
 
 
311 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378943  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  56.39 
 
 
306 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5439  LysR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
306 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  54.98 
 
 
308 aa  338  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3592  LysR family transcriptional regulator  58 
 
 
306 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.503754  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  58.67 
 
 
310 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2112  LysR family transcriptional regulator  54.7 
 
 
307 aa  337  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5025  LysR family transcriptional regulator  58.82 
 
 
302 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  58.64 
 
 
306 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  58.64 
 
 
306 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5656  LysR family transcriptional regulator  56.86 
 
 
306 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1621  LysR family transcriptional regulator  56.94 
 
 
303 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466233  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  53.87 
 
 
307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  52.56 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  55.44 
 
 
315 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  55.44 
 
 
315 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4284  LysR family transcriptional regulator  53.87 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1230  LysR family transcriptional regulator  55.1 
 
 
308 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3165  transcriptional regulator, LysR family  49.31 
 
 
304 aa  295  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 
311 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0846  LysR family transcriptional regulator  52.01 
 
 
237 aa  268  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
326 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3552  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313254 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
308 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
342 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0014  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 
335 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4531  LysR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
307 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5316  LysR family transcriptional regulator  44.01 
 
 
335 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230906  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4977  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 
307 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0012  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
305 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1160  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
305 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1519  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
305 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0015  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
305 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1441  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
305 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428684  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
307 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0015  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
305 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3120  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 
330 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.540342 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
307 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.76 
 
 
307 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2025  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
307 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000110123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1389  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
307 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.955383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2525  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 
307 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01757  hypothetical protein  42.76 
 
 
307 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1834  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
307 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1887  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
307 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09480  transcriptional regulator, LysR family  42.56 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25707  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6570  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.720722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3172  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
307 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1487  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
313 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396455  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0753  LysR substrate binding domain-containing protein  53.19 
 
 
276 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6018  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
300 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2197  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
303 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2024  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
301 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2358  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  44.17 
 
 
302 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6097  transcriptional regulator, LysR family  42.41 
 
 
318 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867989  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1757  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  41 
 
 
313 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000061659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1511  LysR family substrate binding transcriptional regulator  41 
 
 
313 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1615  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 
313 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.502684  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1765  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 
298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389128  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0931  LysR family transcriptional regulator  52.77 
 
 
360 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
300 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
300 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
300 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
300 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
300 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
327 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
327 aa  235  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
327 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0764  LysR substrate binding domain-containing protein  52.77 
 
 
274 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5820  transcriptional regulator, LysR family  37.34 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777062  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0426  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144523  hitchhiker  0.000318501 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1844  transcriptional regulator, LysR family  42.41 
 
 
307 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4815  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
307 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2663  transcriptional regulator, LysR family  41.72 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0779415  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0374  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0367  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02930  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.86 
 
 
310 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0022529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0640  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 
310 aa  232  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0380371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3523  transcriptional activator TtdR  39.86 
 
 
310 aa  232  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00521564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0365  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
321 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.916337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0639  transcriptional activator TtdR  39.86 
 
 
310 aa  232  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000511538  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02880  hypothetical protein  39.86 
 
 
310 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00207281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3353  transcriptional activator TtdR  39.86 
 
 
310 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.577142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>