118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0346 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  30.82 
 
 		 459 aa  70.9  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  39.33 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  38.2 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  38.2 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5187  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.466723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  32.95 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.53 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  22.7 
 
 		 227 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  22.38 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  37.84 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  37.84 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 203 aa  50.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.35 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  23.36 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  33.78 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.84 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  22.92 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.61 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  33.71 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11763  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.83 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 216 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.5 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.96 
 
 		 216 aa  48.5  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 216 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  32.58 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 		 331 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  22.6 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4188  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.73 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.31 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  26.99 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.89 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 267 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 		 357 aa  45.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  42.11 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  26.35 
 
 		 312 aa  45.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  43.14 
 
 		 319 aa  44.7  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  20.78 
 
 		 181 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  32 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4870  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  22.76 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0257995  normal  0.425035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  32 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  32 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  32 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  32 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  32 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  32 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  32 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  32 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  32 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  32 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  26.03 
 
 		 288 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0961007 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  32 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  22.5 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2877  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.13 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 289 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26905  predicted protein  26.73 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0375733  normal  0.0729725 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2070  mutT/nudix family protein  29.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000173279  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  22.29 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  26.02 
 
 		 177 aa  42  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1781  MutT/Nudix family protein  29.09 
 
 		 202 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893185  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 187 aa  42  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  36.71 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1798  MutT/Nudix family protein  29.09 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  25.77 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  26 
 
 		 308 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>