More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3521 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  85.71 
 
 		 219 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19990  transcriptional regulator, GntR family  62.2 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  47.76 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  44.39 
 
 		 242 aa  184  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  41.06 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.82 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.94 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  35.63 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  28.92 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  30.54 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  26.29 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  29.02 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  32.08 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>