122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1947 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1947  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 428 aa  873    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.44 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.06 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.44 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.05 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  21.17 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.46 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.98 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.43 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.7 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  21.55 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.1 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.41 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.26 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 435 aa  50.1  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1672  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0354  ABC transporter substrate binding protein (sn-glycerol 3-phosphate)  24.68 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  24.64 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 		 455 aa  46.6  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.8 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.1 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6153  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3858  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000022263  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  25.56 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 		 426 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>