More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1615 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 230 aa  449  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  25.56 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  22.64 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 228 aa  98.6  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 239 aa  94.7  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  23.81 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  22.37 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  25.24 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  24.57 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  23.22 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  26.9 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 257 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 261 aa  85.1  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 277 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 265 aa  85.1  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  25.56 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  23.35 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  25.56 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  25.6 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  26.86 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.35 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  27.53 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  25.25 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  24.22 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  24.34 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  25.63 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  24.16 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  25.89 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  24.58 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  26.06 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  26.06 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>