118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1342 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 111 aa  216  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  49.45 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  42.72 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  43.69 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  47.25 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  40.66 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  42.11 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  42.11 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  52.24 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  48.65 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  49.33 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  43.01 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  43.37 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  40.57 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  39.62 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  45.56 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  37.63 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  35.35 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  36.27 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  42.05 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  39.36 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  39.36 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  41.57 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  39.76 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  39.29 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  41.25 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  45.24 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  40.26 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  41.11 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  34.83 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  37.08 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  40.79 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  31.25 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  41.25 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  40.24 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  45.07 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.36 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  33.68 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  39.51 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  34.21 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  34.57 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  35.38 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  41.43 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  65.62 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  39.24 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  32.94 
 
 		 113 aa  47.4  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  41.25 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  41.25 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  33.77 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  35.05 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  32.88 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  30.34 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  43.21 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  33.78 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  33.78 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  38.16 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  44.3 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  43.06 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  35.53 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  40.28 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  38.89 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.74 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  29.27 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  36.47 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  32.17 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  31.08 
 
 		 121 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  32.35 
 
 		 93 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  42.67 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>