More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1268 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 375 aa  741    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  37.3 
 
 		 378 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  37.72 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  31.67 
 
 		 370 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  35.44 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  34.39 
 
 		 382 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  32.25 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  33.81 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  34.6 
 
 		 373 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  30.41 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  32.96 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  33.88 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.11 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  33.69 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  30.92 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  30.14 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  32.96 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  35.71 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  30.12 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  36.03 
 
 		 430 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  36.16 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  29.32 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  35.39 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  31.61 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  36.77 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  31.94 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  33 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  32.58 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  33.42 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  33.96 
 
 		 375 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  35.31 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  32.99 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  32.75 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  33.12 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  35.33 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  33.67 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  35.1 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  33.16 
 
 		 435 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  32.45 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  32.74 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  32.81 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  31.74 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  30.47 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  31.75 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  35.14 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  31.34 
 
 		 457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  32.43 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  32.99 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  32.65 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  33.87 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  31.97 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  32.8 
 
 		 384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  25.45 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  31.23 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  31.23 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  30.38 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  32.46 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  31.2 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  35.02 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  26.67 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  33.58 
 
 		 443 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  33.09 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  32.62 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  31.29 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  33.81 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  32.99 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  24.55 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  24.85 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.46 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  29.56 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.25 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  32.32 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.25 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.11 
 
 		 468 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.25 
 
 		 446 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  25.6 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.82 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 455 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.94 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  28.34 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4412  geranylgeranyl reductase  36.17 
 
 		 426 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0475548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  27.12 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  30.73 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>