More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3246 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  62.76 
 
 
772 aa  919    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
727 aa  1498    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  59.95 
 
 
766 aa  900    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  75.83 
 
 
723 aa  1117    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40.14 
 
 
727 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  38.49 
 
 
784 aa  459  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  39.01 
 
 
833 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  38.7 
 
 
807 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  39.01 
 
 
765 aa  439  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  40.8 
 
 
821 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  38.38 
 
 
773 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.38 
 
 
821 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  37.72 
 
 
801 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.96 
 
 
763 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  38 
 
 
820 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  37.97 
 
 
838 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  35.5 
 
 
892 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  37.96 
 
 
789 aa  389  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  36.06 
 
 
880 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  35.01 
 
 
740 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  36.01 
 
 
744 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
819 aa  359  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  34.45 
 
 
739 aa  353  8e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.76 
 
 
737 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 
1057 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
807 aa  349  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  34.91 
 
 
771 aa  339  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.7 
 
 
817 aa  335  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  33.29 
 
 
773 aa  333  8e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.67 
 
 
736 aa  330  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  31.21 
 
 
768 aa  325  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 
759 aa  321  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 
747 aa  316  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  34.19 
 
 
721 aa  310  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
758 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  35.32 
 
 
726 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  34.79 
 
 
877 aa  307  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 
705 aa  306  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
758 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 
710 aa  298  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
710 aa  298  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
871 aa  296  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  34.55 
 
 
814 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  33.8 
 
 
722 aa  285  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 
723 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
801 aa  279  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 
766 aa  276  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.42 
 
 
751 aa  276  9e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 
808 aa  274  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.83 
 
 
761 aa  272  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  32.65 
 
 
680 aa  259  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  31.78 
 
 
693 aa  258  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.04 
 
 
710 aa  257  4e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  33.23 
 
 
750 aa  256  8e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.96 
 
 
720 aa  253  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.35 
 
 
695 aa  252  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  29.77 
 
 
830 aa  247  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.35 
 
 
710 aa  246  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.63 
 
 
648 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.2 
 
 
643 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  27.79 
 
 
806 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.58 
 
 
761 aa  238  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 
840 aa  236  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.48 
 
 
618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  29.32 
 
 
727 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  29.6 
 
 
755 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  27.02 
 
 
774 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  30.73 
 
 
730 aa  234  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  29.64 
 
 
707 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.61 
 
 
765 aa  233  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  29.15 
 
 
640 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  30.16 
 
 
709 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  27.55 
 
 
648 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  30.16 
 
 
709 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  30.16 
 
 
709 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.69 
 
 
661 aa  231  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  30.2 
 
 
762 aa  229  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  28.65 
 
 
750 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  30.16 
 
 
714 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  30.57 
 
 
760 aa  229  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  30.31 
 
 
705 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.14 
 
 
739 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
818 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  29.19 
 
 
683 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  28.3 
 
 
640 aa  225  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  30.77 
 
 
752 aa  225  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
700 aa  225  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  29.53 
 
 
649 aa  224  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  31.14 
 
 
726 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 
816 aa  224  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  30.42 
 
 
734 aa  224  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.63 
 
 
764 aa  223  7e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  29.48 
 
 
625 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.16 
 
 
720 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 
703 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  28.48 
 
 
683 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  30.31 
 
 
980 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.06 
 
 
890 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  31.13 
 
 
734 aa  221  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
824 aa  220  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>