61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0135 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0135  cellulase  100 
 
 
469 aa  959    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  46.98 
 
 
501 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  44.18 
 
 
434 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  38.06 
 
 
419 aa  246  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.93 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  35.01 
 
 
393 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  34.36 
 
 
380 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  32.39 
 
 
323 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  33.16 
 
 
437 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  34.62 
 
 
487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  31.61 
 
 
459 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  33.23 
 
 
341 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  34.08 
 
 
495 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  32.35 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  33.33 
 
 
491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  28.91 
 
 
441 aa  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  32.68 
 
 
465 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  33.14 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  34.64 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  34.64 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  34.64 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  28.84 
 
 
456 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  32.93 
 
 
330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  31.32 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  30.14 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  31.06 
 
 
326 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  27.93 
 
 
371 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  29.82 
 
 
439 aa  114  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  29.67 
 
 
393 aa  113  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  28.34 
 
 
655 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  27.34 
 
 
611 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 
1128 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  26.72 
 
 
350 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  27.49 
 
 
346 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  28.49 
 
 
870 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 
589 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.65 
 
 
469 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 
620 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  26.1 
 
 
394 aa  97.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  27.46 
 
 
767 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.09 
 
 
633 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  28.53 
 
 
361 aa  96.3  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  25.81 
 
 
623 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  28.35 
 
 
646 aa  94  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
1209 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  26.2 
 
 
596 aa  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  27.01 
 
 
605 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  28.45 
 
 
450 aa  90.5  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.43 
 
 
469 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  28.85 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  26.46 
 
 
548 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  26.26 
 
 
487 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  27.14 
 
 
791 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.66 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.98 
 
 
588 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.62 
 
 
639 aa  81.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  27.33 
 
 
572 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  24.44 
 
 
628 aa  81.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.74 
 
 
590 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  26.62 
 
 
743 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  28.57 
 
 
497 aa  57.4  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>