193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1521 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  100 
 
 		 340 aa  693    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  51 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  48.84 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  50.59 
 
 		 333 aa  333  4e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  47.98 
 
 		 337 aa  329  3e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  49.13 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  48.27 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  48.22 
 
 		 334 aa  301  9e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  46.84 
 
 		 338 aa  299  4e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  47.49 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  47.65 
 
 		 334 aa  298  6e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  47.93 
 
 		 334 aa  298  7e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  47.35 
 
 		 334 aa  298  8e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  49.13 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  45.85 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  45.98 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  45.11 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  49.86 
 
 		 335 aa  289  6e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  48.08 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  49.29 
 
 		 347 aa  281  8.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  47.52 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  46.65 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  47.37 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  46.08 
 
 		 338 aa  258  8e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  42.65 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  42.98 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  40.48 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.36 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  38.12 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  33.98 
 
 		 390 aa  196  7e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  34.72 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  35.08 
 
 		 389 aa  185  8e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  29.41 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  28.67 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  28.27 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  29.03 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  29.61 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  27.3 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  26.6 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  27.04 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  26.83 
 
 		 211 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  27.18 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  26.83 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34483  predicted protein  27.54 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000711163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  28.2 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  27.95 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  26.13 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  25.78 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  28.2 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  25.61 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  29.39 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  29.96 
 
 		 216 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  28.57 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  25.78 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  25.51 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  26.04 
 
 		 216 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04521  50S ribosomal protein L3  27.34 
 
 		 207 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000554969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  27.75 
 
 		 212 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  28.25 
 
 		 218 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  29.55 
 
 		 206 aa  53.5  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  25.26 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  25.53 
 
 		 214 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  26.94 
 
 		 212 aa  53.1  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  27.66 
 
 		 247 aa  53.1  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  25.09 
 
 		 241 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  25.26 
 
 		 217 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  24.91 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  25.53 
 
 		 212 aa  52.8  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  25.26 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  26.15 
 
 		 219 aa  52.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  29.96 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  25 
 
 		 220 aa  52.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  23.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  25.09 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  24.74 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  25.44 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  25.8 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  25.52 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  26.69 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  24.56 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  28.47 
 
 		 219 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  24.56 
 
 		 247 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  24.39 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  27.74 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  28.02 
 
 		 209 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  25.09 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  24.56 
 
 		 217 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>