More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34483 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_34483  predicted protein  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000711163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  46.92 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1679  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123125  hitchhiker  0.0000530368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  48.84 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 246 aa  188  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  46.48 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  45.07 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  47.89 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 245 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0986  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191064  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  44.13 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 247 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1353  50S ribosomal protein L3  43.24 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.685053  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  44.02 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 227 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02690  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  42.18 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  45.05 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  44.02 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  44.02 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  46.15 
 
 		 219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 218 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  44.6 
 
 		 219 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  43.98 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  43.93 
 
 		 216 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  43.72 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  44.85 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  44.71 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  45.13 
 
 		 218 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  44.34 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  43.27 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  42.52 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  42.52 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  43.66 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 210 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  42.99 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  42.99 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  42.99 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  42.34 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  41.83 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  41.83 
 
 		 214 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  43.63 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 218 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 216 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0391  50S ribosomal protein L3  43.06 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000698132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  42.11 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_002978  WD0681  50S ribosomal protein L3  41.86 
 
 		 240 aa  150  3e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0111701  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  42.45 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0337  50S ribosomal protein L3  41.15 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  42.58 
 
 		 212 aa  149  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  40.57 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  42.51 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  41.83 
 
 		 212 aa  148  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000808775  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04521  50S ribosomal protein L3  43.2 
 
 		 207 aa  148  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000554969  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1854  50S ribosomal protein L3  40.67 
 
 		 217 aa  148  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000292484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0612  50S ribosomal protein L3  41.04 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>