More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0612 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0612  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0409  50S ribosomal protein L3  88.31 
 
 		 231 aa  424  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.214097  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0681  50S ribosomal protein L3  61.64 
 
 		 240 aa  285  5.999999999999999e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0111701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  50.93 
 
 		 290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  49.1 
 
 		 245 aa  218  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  51.36 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  48.84 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  48.84 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  48.85 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  48.61 
 
 		 251 aa  212  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  48.61 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  48.61 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  47.71 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  46.51 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0986  50S ribosomal protein L3  47.22 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191064  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  47.71 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  47.71 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  46.3 
 
 		 242 aa  204  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  47.22 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0266  ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 210 aa  201  6e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000356629  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  46.26 
 
 		 213 aa  201  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  44.91 
 
 		 245 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1353  50S ribosomal protein L3  46.15 
 
 		 317 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.685053  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  46.67 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  44.34 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  46.01 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1679  50S ribosomal protein L3  46.76 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123125  hitchhiker  0.0000530368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  44.8 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  44.74 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  45.37 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  46.3 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  47.14 
 
 		 214 aa  188  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  44.91 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  44.91 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  45.37 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  43.52 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  43.72 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  43.72 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  43.26 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  43.98 
 
 		 243 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  46.76 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  44.86 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  42.38 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 209 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.147880000000001e-24  hitchhiker  0.0000384813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  43.75 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  43.27 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  43.27 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  44.5 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  43.46 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  42.38 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  43.13 
 
 		 216 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  43.27 
 
 		 211 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 		 212 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  43.27 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0394  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0369  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  45.25 
 
 		 296 aa  165  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02690  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  43.13 
 
 		 308 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881266  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  45.12 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  45.12 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 209 aa  165  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000354089  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  41.31 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  42.18 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0267  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000416166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3759  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000358076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>