More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0409 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0409  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.214097  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0612  50S ribosomal protein L3  88.31 
 
 		 231 aa  424  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0681  50S ribosomal protein L3  59.36 
 
 		 240 aa  271  7e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0111701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  49.07 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0266  ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000356629  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  47.47 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  49.54 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  49.54 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  47.53 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  49.54 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  49.54 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0986  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191064  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  46.79 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  46.79 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  46.79 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  48.17 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  47.3 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  46.95 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  47.22 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  47.2 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  46.19 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1353  50S ribosomal protein L3  45.21 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.685053  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1679  50S ribosomal protein L3  45.54 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123125  hitchhiker  0.0000530368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  46.95 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  44.75 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  43.93 
 
 		 245 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  43.86 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  43.19 
 
 		 213 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  43.44 
 
 		 227 aa  184  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  42.06 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  42.72 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  44.13 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  42.98 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  44.13 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  46.19 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  45.83 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  44.13 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  43.66 
 
 		 246 aa  177  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  43.66 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  43.19 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  44.13 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  43.19 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  43.19 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  42.25 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  44.95 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  43.46 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.147880000000001e-24  hitchhiker  0.0000384813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  41.59 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 216 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  41.83 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0494  50S ribosomal protein L3  42.86 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000368377  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  41.78 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 211 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  41.71 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0433  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 		 210 aa  162  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000241052  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 211 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 211 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  41.83 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  42.86 
 
 		 214 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0858  ribosomal protein L3  40.19 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.451508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  41.83 
 
 		 209 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  43.06 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  43.27 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  41.35 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  41.9 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  41.83 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  43.54 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 212 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  42.31 
 
 		 211 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  42.31 
 
 		 211 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  43.75 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  42.86 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  41.35 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3999  50S ribosomal protein L3  40.64 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166113 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02690  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  42.65 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881266  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>