More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0666 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  83.86 
 
 		 237 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  83.86 
 
 		 237 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  84.02 
 
 		 238 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  78.48 
 
 		 242 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0986  50S ribosomal protein L3  72.9 
 
 		 228 aa  335  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191064  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  75.12 
 
 		 213 aa  330  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  69.03 
 
 		 239 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  69.96 
 
 		 251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  74.64 
 
 		 213 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  66.96 
 
 		 279 aa  324  8.000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  74.16 
 
 		 213 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  63.91 
 
 		 235 aa  319  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  69.77 
 
 		 240 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  69.77 
 
 		 240 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 		 239 aa  313  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  65.49 
 
 		 245 aa  311  7.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  64.84 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  64.38 
 
 		 245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  62.78 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  63.18 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1679  50S ribosomal protein L3  61.89 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123125  hitchhiker  0.0000530368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  60.91 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  62.98 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  64.32 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  65.02 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1353  50S ribosomal protein L3  57.89 
 
 		 317 aa  289  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.685053  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  59.26 
 
 		 246 aa  288  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  63.03 
 
 		 241 aa  287  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  61.43 
 
 		 256 aa  287  9e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  58.85 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  57.55 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  58.85 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  62.5 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  65.3 
 
 		 239 aa  284  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  64.13 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  64.38 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  64.13 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  57.26 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  56.64 
 
 		 227 aa  261  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  54.46 
 
 		 227 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  52.86 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  53.55 
 
 		 214 aa  221  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  53.08 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  52.8 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 216 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0612  50S ribosomal protein L3  48.61 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  50.97 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0266  ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 210 aa  208  5e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000356629  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 209 aa  208  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  50.71 
 
 		 214 aa  207  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_002978  WD0681  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0111701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 215 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.147880000000001e-24  hitchhiker  0.0000384813 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0409  50S ribosomal protein L3  49.54 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.214097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  51.17 
 
 		 214 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  52.13 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3999  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0767  ribosomal protein L3  48.39 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.357159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  50.23 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 212 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3804  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000896818  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3478  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.00000000879138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3169  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000263976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2632  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000488611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3776  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000325408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3746  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000021686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1924  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000132844  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02690  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  46.19 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881266  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  49.29 
 
 		 212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  49.77 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3068  50S ribosomal protein L3  48.83 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000718216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  49.77 
 
 		 218 aa  198  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  47.89 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  49.29 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  49.53 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  49.29 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  47.89 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  48.83 
 
 		 219 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 219 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  49.03 
 
 		 222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0273  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000366458  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0278  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000211938  decreased coverage  0.00000000129288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 215 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>