More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_1184 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1184  pseudouridine synthase  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1820  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  73.31 
 
 
288 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1557  pseudouridine synthase  58.2 
 
 
252 aa  287  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1581  pseudouridine synthase  58.2 
 
 
252 aa  287  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0394  pseudouridine synthase  58.7 
 
 
261 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.734579 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1293  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  56.45 
 
 
254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.159925  normal  0.17953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4316  pseudouridine synthase  55.65 
 
 
259 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.43 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09831  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal small subunit  50.42 
 
 
244 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1616  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  53.74 
 
 
250 aa  230  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  0.0569453 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1377  pseudouridine synthase, Rsu  53.24 
 
 
247 aa  225  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11041  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase  46.75 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0249401  normal  0.321161 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07230  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.98 
 
 
237 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000010493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1545  pseudouridine synthase  42.86 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  45.53 
 
 
271 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  46.59 
 
 
556 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  44.53 
 
 
251 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  46.15 
 
 
624 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1643  pseudouridine synthase  42.8 
 
 
238 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.734555 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  43.98 
 
 
309 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  41.74 
 
 
236 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1352  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.5 
 
 
240 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.92415  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  43.85 
 
 
264 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  41.6 
 
 
266 aa  184  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.06 
 
 
249 aa  184  8e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  41.53 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  42.91 
 
 
567 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.83 
 
 
239 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.46 
 
 
247 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.45 
 
 
236 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  42.4 
 
 
255 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  42.11 
 
 
241 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.46 
 
 
258 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0683  pseudouridine synthase  44.13 
 
 
250 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.316582  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  39.42 
 
 
235 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0369  pseudouridine synthase  42.74 
 
 
251 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  42.11 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  40.96 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.57 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0398  pseudouridine synthase  42.21 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06820  pseudouridine synthase family protein  37.34 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.493821 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.09 
 
 
249 aa  171  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.531864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1919  pseudouridine synthase  38.93 
 
 
256 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  40.87 
 
 
273 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1147  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.58 
 
 
236 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000045472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.4 
 
 
238 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1211  pseudouridine synthase  41.06 
 
 
243 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1336  ribosomal small subunit pseudouridine synthase B  39.58 
 
 
236 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.15 
 
 
240 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  40.24 
 
 
238 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11726  hypothetical protein  41.47 
 
 
254 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2223  pseudouridine synthase  40.74 
 
 
243 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000780288  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2817  pseudouridine synthase  40.49 
 
 
329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1401  pseudouridine synthase  40.24 
 
 
250 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1928  pseudouridine synthase  41.47 
 
 
306 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262991  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1597  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.75 
 
 
242 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3276  pseudouridine synthase  39.59 
 
 
247 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0129049  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.75 
 
 
242 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1196  pseudouridine synthase  39.92 
 
 
242 aa  165  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1354  pseudouridylate synthase  38.75 
 
 
242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1928  pseudouridine synthase  38.52 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0159722  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2973  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.18 
 
 
247 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855259  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.18 
 
 
247 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  0.0913763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.18 
 
 
247 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1565  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.75 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37262e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1382  RNA pseudouridine  38.75 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.947274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1355  pseudouridylate synthase  38.75 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1493  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.75 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.73 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.411992  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1527  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.75 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  40.57 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3818  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.75 
 
 
242 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000641699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19880  pseudouridine synthase family protein  43.64 
 
 
263 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1534  pseudouridine synthase, Rsu  39.63 
 
 
406 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.66 
 
 
269 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  38.89 
 
 
680 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5061  pseudouridine synthase  38.68 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0210858  normal  0.0392738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1454  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39 
 
 
252 aa  161  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00702616 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1534  pseudouridine synthase  39.63 
 
 
403 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000449556 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1330  pseudouridine synthase  34.17 
 
 
282 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1395  pseudouridine synthase  38.52 
 
 
242 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0058  pseudouridine synthase  41.77 
 
 
241 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4425  pseudouridine synthase  39.27 
 
 
244 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.223617  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2174  pseudouridine synthase  38.4 
 
 
329 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3495  pseudouridine synthase  38.78 
 
 
247 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0394567  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2263  pseudouridine synthase  38.4 
 
 
324 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0689065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.13 
 
 
255 aa  158  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  39.36 
 
 
274 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2458  pseudouridine synthase  38.31 
 
 
332 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1807  pseudouridine synthase  38.21 
 
 
240 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1206  pseudouridine synthase, Rsu  39.68 
 
 
375 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5639  pseudouridine synthase  40.16 
 
 
553 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2122  pseudouridine synthase  38.25 
 
 
354 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327075  normal  0.0800596 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0723  pseudouridine synthase  37.08 
 
 
279 aa  155  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0159498  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1682  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.45 
 
 
328 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00200841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3744  pseudouridine synthase  41.08 
 
 
233 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.0135633 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3005  RNA-binding S4 domain protein  38.93 
 
 
369 aa  154  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2989  pseudouridine synthase  37.14 
 
 
280 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1270  pseudouridine synthase  39.17 
 
 
265 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4054  pseudouridine synthase  39.2 
 
 
249 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>