More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1774 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  100 
 
 
291 aa  589  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  48.96 
 
 
299 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  48.96 
 
 
299 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  46.53 
 
 
300 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  45.7 
 
 
300 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  45.36 
 
 
300 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  45.36 
 
 
299 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  47.59 
 
 
297 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  49.31 
 
 
306 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  48.86 
 
 
300 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  50.17 
 
 
296 aa  250  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  45.52 
 
 
296 aa  249  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  47.95 
 
 
295 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  47.26 
 
 
295 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  49.48 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  45.26 
 
 
312 aa  242  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  45.49 
 
 
320 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  47.22 
 
 
299 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  46.69 
 
 
309 aa  237  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  44.48 
 
 
301 aa  236  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  43.69 
 
 
297 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  46.04 
 
 
316 aa  235  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  48.36 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  47.73 
 
 
297 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  46.78 
 
 
299 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  42.76 
 
 
307 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  49.39 
 
 
299 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  45.69 
 
 
337 aa  229  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  43.59 
 
 
297 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  47.47 
 
 
290 aa  224  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  45.8 
 
 
293 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  45.02 
 
 
294 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  44.83 
 
 
294 aa  222  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  49.08 
 
 
297 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  44.11 
 
 
293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  44.66 
 
 
293 aa  222  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  44.22 
 
 
315 aa  222  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.71 
 
 
299 aa  221  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  41.78 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  41.78 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  45.79 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  42.22 
 
 
294 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  46.24 
 
 
306 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.75 
 
 
293 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  46.29 
 
 
297 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  45.52 
 
 
296 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  48.96 
 
 
297 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  43.94 
 
 
290 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  42.75 
 
 
293 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  48.15 
 
 
299 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  42.75 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  45.55 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  44.49 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  42.75 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  42.75 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  43.3 
 
 
295 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  42.37 
 
 
293 aa  215  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  45.2 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  43.68 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  45.15 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  49.81 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  38.75 
 
 
290 aa  212  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  45.82 
 
 
297 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  40.14 
 
 
290 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  43.1 
 
 
293 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  42.75 
 
 
293 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  44.03 
 
 
295 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  40.14 
 
 
290 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  46.49 
 
 
297 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  47.1 
 
 
299 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  47.1 
 
 
299 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  47.1 
 
 
299 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  47.1 
 
 
299 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  46.21 
 
 
307 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  47.1 
 
 
299 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  47.12 
 
 
299 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  47.12 
 
 
299 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  47.12 
 
 
299 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  47.12 
 
 
299 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  47.12 
 
 
299 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  47.12 
 
 
299 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  47.12 
 
 
299 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  46.9 
 
 
295 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  47.37 
 
 
302 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  44.7 
 
 
296 aa  205  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  46.9 
 
 
295 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  46.78 
 
 
299 aa  205  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  46.9 
 
 
295 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  44.7 
 
 
296 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  42.96 
 
 
293 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  44.7 
 
 
296 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  42.96 
 
 
293 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  45.66 
 
 
296 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  44.7 
 
 
296 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  42.76 
 
 
296 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  42.76 
 
 
296 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  42.76 
 
 
296 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  44.44 
 
 
297 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  42.76 
 
 
296 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  44.32 
 
 
297 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>