271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0719 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0719  truncated cytochrome c oxidase  100 
 
 		 142 aa  294  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0635  hypothetical protein  94.37 
 
 		 142 aa  278  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  59.42 
 
 		 216 aa  173  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  56.83 
 
 		 216 aa  170  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 211 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  35.46 
 
 		 210 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  35.46 
 
 		 210 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 210 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  33.81 
 
 		 210 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 210 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  39.42 
 
 		 231 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 211 aa  84.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  33.57 
 
 		 219 aa  83.6  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  33.81 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  34.29 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  33.57 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  30.3 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  30.3 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  30.5 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  37.23 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  31.62 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  40.87 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  40.87 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  40.87 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.88 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  41.74 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  40.87 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  40.87 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  35.77 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  41.74 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  40.87 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  40.87 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  41.74 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  40.87 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  41.74 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  41.74 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 		 220 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 210 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  40.87 
 
 		 205 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  40.87 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  29.29 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  33.81 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  40.87 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  31.16 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  37.68 
 
 		 203 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  35.65 
 
 		 198 aa  73.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  29.32 
 
 		 203 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 207 aa  73.9  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  37.68 
 
 		 203 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 205 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  32.62 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  34.51 
 
 		 197 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  33.56 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  32.61 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  36.52 
 
 		 215 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.51 
 
 		 221 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  40.17 
 
 		 200 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 197 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  30.33 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  34.06 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  31.54 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.59 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  30.28 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  33.91 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  35.09 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  25.71 
 
 		 206 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  34.43 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  29.37 
 
 		 212 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  32.85 
 
 		 212 aa  67  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 210 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  33.62 
 
 		 210 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 219 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 219 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 219 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 210 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 210 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 210 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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