264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0635 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0635  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  293  4e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0719  truncated cytochrome c oxidase  94.37 
 
 
142 aa  278  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  57.97 
 
 
216 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  53.96 
 
 
216 aa  163  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 
211 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  36.43 
 
 
211 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  34.27 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  35.29 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.23 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 
210 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  29.55 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  29.55 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  37.78 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 
210 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  29.79 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  34.31 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 
196 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  38.26 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  38.26 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  27.46 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  38.26 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  38.26 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  38.26 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  38.26 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  38.26 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  38.26 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  31.88 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  31.69 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  35.66 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1941  SCO1/SenC family protein  31.91 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000240174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  39.66 
 
 
205 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 
207 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  31.43 
 
 
211 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
210 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  39.66 
 
 
205 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 
206 aa  73.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  30.71 
 
 
211 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  31.91 
 
 
207 aa  72  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  38.79 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  27.07 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  38.26 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  30.88 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 
197 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  35.34 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 
199 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  33.04 
 
 
209 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  30.88 
 
 
192 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  32.19 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  33.81 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  37.39 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  31.45 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  31.62 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  31.11 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 
239 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  30.37 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  26.95 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  29.51 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  31.71 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  32.09 
 
 
204 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
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NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  35.09 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  28.26 
 
 
205 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 
221 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 
203 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  31.65 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  24.29 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  29.2 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  32.52 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0373  lipoprotein  36.21 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  32.52 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
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NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  29.63 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
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NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  29.51 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0796  hypothetical protein  29.71 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  32.61 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
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NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  29.69 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  32.23 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  28.67 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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