More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3235 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3235  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 314 aa  634    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.225492  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5269  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.58 
 
 		 317 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.16 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  43.27 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  40.95 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  41.99 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  40.45 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.69 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  41.29 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.75 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  43.56 
 
 		 297 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  39.41 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  38.11 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  41.1 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  37.79 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  43.19 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  40.26 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  39.74 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  42.63 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  37.75 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.61 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.87 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  40.94 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  37.58 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  40.07 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  41.28 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.07 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.58 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  39.48 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  38.96 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  38.96 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.11 
 
 		 308 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.51 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  38.64 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  36.42 
 
 		 329 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  37.82 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  37.09 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5964  pyruvate carboxyltransferase  36.98 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0367175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  40.27 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  38.41 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0477  pyruvate carboxyltransferase  38.18 
 
 		 308 aa  189  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  38.85 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.92 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  38.78 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.61 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  39.02 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  39.34 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  38.36 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  39.8 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.26 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  39.26 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4155  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.59 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  38.61 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.2 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.74 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  36.48 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.2 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.2 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.83 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  35.55 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4710  pyruvate carboxyltransferase  35.69 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  37.66 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.87 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.2 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.2 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.2 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.2 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.2 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.33 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  37.66 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  37.66 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  42.46 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  41.2 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  39.6 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.2 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.87 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  40.46 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  38.96 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  37.76 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  39.19 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.11 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  39.23 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  37.91 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.61 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0514  pyruvate carboxyltransferase  37.88 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00792422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.64 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.95 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.95 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.61 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.74 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  39.07 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0961  pyruvate carboxyltransferase  38.61 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  39.22 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.62 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000381  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.03 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  36.25 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1588  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.66 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1612  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.66 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  36.97 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.38 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>