More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0889 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0889  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.110424  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3823  hypothetical protein  74.77 
 
 
330 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363673  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  59.12 
 
 
341 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  51.48 
 
 
338 aa  341  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.9 
 
 
328 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.9 
 
 
328 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.94 
 
 
327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.75 
 
 
339 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 
330 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.66 
 
 
330 aa  235  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.66 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.48 
 
 
333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.75 
 
 
331 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.55 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  39.16 
 
 
330 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.98 
 
 
332 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  39.3 
 
 
336 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.9 
 
 
325 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.08 
 
 
331 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.18 
 
 
339 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.36 
 
 
335 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  42.02 
 
 
331 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.02 
 
 
336 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40 
 
 
332 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.61 
 
 
325 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  39.48 
 
 
314 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  39.19 
 
 
325 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.1 
 
 
331 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  39.19 
 
 
325 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  42.03 
 
 
333 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.73 
 
 
327 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.38 
 
 
333 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.24 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  36.27 
 
 
328 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.87 
 
 
328 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.67 
 
 
345 aa  222  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.14 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.67 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  40 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.28 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.86 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  41.2 
 
 
314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.51 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  38.98 
 
 
343 aa  219  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  39.8 
 
 
305 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.91 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.91 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.23 
 
 
336 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.14 
 
 
334 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.34 
 
 
332 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.33 
 
 
325 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.17 
 
 
323 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.74 
 
 
310 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.86 
 
 
339 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  40.82 
 
 
332 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.59 
 
 
322 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 
334 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.74 
 
 
337 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  40.41 
 
 
330 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.67 
 
 
322 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.44 
 
 
325 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1006  twin-arginine translocation pathway signal  36.56 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  37.08 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  38.98 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  39.49 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  37.27 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  39.53 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.06 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  39.39 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  36.5 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  39.4 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.11 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  38.89 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  40.27 
 
 
335 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.14 
 
 
338 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  40.28 
 
 
339 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.73 
 
 
360 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0971  twin-arginine translocation pathway signal  36.67 
 
 
333 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.694014  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  39.8 
 
 
324 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.37 
 
 
335 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.88 
 
 
304 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.8 
 
 
321 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  37.88 
 
 
324 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.94 
 
 
356 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  37.63 
 
 
334 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.62 
 
 
349 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.06 
 
 
314 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  38.38 
 
 
317 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.54 
 
 
330 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 
323 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  37.86 
 
 
337 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.43 
 
 
336 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  39.67 
 
 
337 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  38.38 
 
 
317 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1429  hypothetical protein  42.21 
 
 
321 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.46 
 
 
341 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  37.76 
 
 
320 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>