262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0127 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0127  dihydrofolate reductase  100 
 
 
156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl383  dihydrofolate reductase  34.15 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0297062  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1031  Dihydrofolate reductase  33.86 
 
 
191 aa  93.2  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1528  Dihydrofolate reductase  34.4 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4438  Dihydrofolate reductase  34.43 
 
 
171 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58897  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  31.74 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  36.72 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3945  Dihydrofolate reductase  27.41 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0678721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2865  Dihydrofolate reductase  30 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0682498 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0770  dihydrofolate reductase  34.06 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2731  Dihydrofolate reductase  30.88 
 
 
194 aa  84.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  28.15 
 
 
161 aa  84.7  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4921  Dihydrofolate reductase  34.38 
 
 
167 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.521908  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1013  dihydrofolate reductase  33.88 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.556231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3019  dihydrofolate reductase  29.1 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  35.16 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  35.83 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  38.46 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  27.78 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3945  Dihydrofolate reductase  30.36 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22083  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17470  dihydrofolate reductase  29.79 
 
 
186 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633982  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2833  Dihydrofolate reductase  27.33 
 
 
185 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  28.79 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1761  Dihydrofolate reductase  28.47 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  29.55 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1728  dihydrofolate reductase  35.59 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  34.4 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  34.4 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  34.4 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  34.4 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  34.4 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  34.4 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  28.48 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  33.85 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4006  dihydrofolate reductase  31.82 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0164  Dihydrofolate reductase  34.48 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0404291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0054  dihydrofolate reductase  34.51 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  29.13 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  34.38 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  31.78 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  31.2 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  30.71 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23300  dihydrofolate reductase  30.58 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.708739  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  26.36 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12776  dihydrofolate reductase dfrA (tetrahydrofolate dehydrogenase)  32.46 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  30.67 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  31.07 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2381  dihydrofolate reductase  30 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0442156 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1681  Dihydrofolate reductase  27.85 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0623  dihydrofolate reductase  28.57 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  33.61 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  29.38 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  32.56 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29380  dihydrofolate reductase  24.67 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  27.69 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  32.56 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  27.59 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  31.71 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0989  dihydrofolate reductase region  30.63 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  33.07 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2113  dihydrofolate reductase  31.53 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  30.49 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2100  dihydrofolate reductase  31.53 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0831  dihydrofolate reductase  31.29 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000151073  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2159  dihydrofolate reductase  31.53 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1790  dihydrofolate reductase  31.69 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.366325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0051  dihydrofolate reductase  33.81 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1314  dihydrofolate reductase  26.75 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0847  dihydrofolate reductase  31.9 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  35.9 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  26.92 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2177  dihydrofolate reductase region  31.36 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.22397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  28.57 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0561  dihydrofolate reductase  32.74 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2043  dihydrofolate reductase  28.17 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  30.07 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  28.29 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2754  dihydrofolate reductase  36.52 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  28.79 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  34.29 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1270  dihydrofolate reductase  26.24 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000534166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  34.29 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  28.57 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0389  dihydrofolate reductase  28.17 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  29.41 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  26.79 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  32.38 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  34.96 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  34.4 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  27.87 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  28.12 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  33.05 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  34.29 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  27.01 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  29.06 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  23.88 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  28.12 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  28.12 
 
 
337 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>