More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1660 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1660  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 454 aa  887    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1322  sodium:dicarboxylate symporter  67.83 
 
 		 480 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1278  sodium:dicarboxylate symporter  67.38 
 
 		 476 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.421424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4122  sodium:dicarboxylate symporter  67.22 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16520  Na+/H+ dicarboxylate symporter  63.44 
 
 		 477 aa  504  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2831  sodium:dicarboxylate symporter  66.28 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  61.32 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  64.6 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.02362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3163  sodium:dicarboxylate symporter  63.5 
 
 		 456 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28490  Na+/H+ dicarboxylate symporter  64.73 
 
 		 495 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3945  sodium:dicarboxylate symporter  62.36 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1315  sodium:dicarboxylate symporter  60.67 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2338  sodium:dicarboxylate symporter  59.91 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276413  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1358  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2850  hypothetical protein  56.12 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3041  sodium:dicarboxylate symporter  54.65 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0982219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6394  sodium:dicarboxylate symporter  44.8 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  38.05 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  37.13 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  37.13 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  35.99 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  38.96 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  37.98 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  37.98 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  37.98 
 
 		 419 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  37.98 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  34.21 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  33.94 
 
 		 442 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  38.92 
 
 		 427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  38.52 
 
 		 413 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 416 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  34.19 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  34.01 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  33.41 
 
 		 424 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  36.01 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  37.44 
 
 		 417 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  35 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  34.24 
 
 		 444 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  38.92 
 
 		 441 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  34.24 
 
 		 444 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  32.78 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  34.01 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  33.17 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  33.11 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  33.11 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  33.88 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  37.64 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  33.57 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  35.38 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 440 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 437 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  33.81 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  33.87 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 437 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  39.18 
 
 		 417 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  39.18 
 
 		 417 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  33.79 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  33.8 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  38.72 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  31.29 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  31.81 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  39.8 
 
 		 416 aa  206  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  37.94 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  33.98 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  29.96 
 
 		 445 aa  202  9e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  32.16 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  31.74 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  31.03 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  32.16 
 
 		 434 aa  200  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  33.41 
 
 		 417 aa  200  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  31.59 
 
 		 409 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  31.57 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  35.66 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  34.86 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.86 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  32.86 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  31.07 
 
 		 447 aa  196  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  28.96 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  30.32 
 
 		 449 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  33.25 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  32.18 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  30.79 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  32.18 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  30.86 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  33.76 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  33.17 
 
 		 424 aa  184  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  30.68 
 
 		 408 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  33.49 
 
 		 436 aa  179  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  31.1 
 
 		 438 aa  179  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  30.42 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  30.42 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  30.42 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  30.14 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  29.55 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  29.86 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  30.09 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>