More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2338 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2338  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 439 aa  827    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276413  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3163  sodium:dicarboxylate symporter  67.52 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4122  sodium:dicarboxylate symporter  66.41 
 
 		 444 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1322  sodium:dicarboxylate symporter  59.63 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  62.18 
 
 		 479 aa  473  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.02362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1278  sodium:dicarboxylate symporter  60.48 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.421424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2831  sodium:dicarboxylate symporter  62.06 
 
 		 477 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3945  sodium:dicarboxylate symporter  60.7 
 
 		 480 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  59.55 
 
 		 500 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28490  Na+/H+ dicarboxylate symporter  64.42 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16520  Na+/H+ dicarboxylate symporter  58.33 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1315  sodium:dicarboxylate symporter  61.2 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1358  sodium:dicarboxylate symporter  62.5 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2850  hypothetical protein  55.33 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3041  sodium:dicarboxylate symporter  54.94 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0982219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1660  sodium:dicarboxylate symporter  59.91 
 
 		 454 aa  352  7e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6394  sodium:dicarboxylate symporter  44.8 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  41.45 
 
 		 444 aa  265  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  39.15 
 
 		 439 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  39.76 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  39.76 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  37.35 
 
 		 430 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  39.2 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  38.16 
 
 		 413 aa  229  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  38.7 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  38.7 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  38.7 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  38.7 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  36.39 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  36.94 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  36.94 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  36.94 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  36.39 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  36.39 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  36.39 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  40.36 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  39.57 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  36.47 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  39.28 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  39.84 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  35.18 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  39.28 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  38.75 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  35.76 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  39.04 
 
 		 417 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  34.93 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  38.55 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  34.35 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  36.03 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  38.7 
 
 		 426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  33.97 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  36.67 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  32.32 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  33.98 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  32.94 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  32.52 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  32.47 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  33.01 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  32.62 
 
 		 436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  31.1 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  32.3 
 
 		 440 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  32.3 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  32.3 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  32.54 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  32.71 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  32.24 
 
 		 437 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  32.94 
 
 		 449 aa  192  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  35.12 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  34.94 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.94 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.12 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  34.94 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  34.94 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  31.66 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  34.38 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  34.88 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  31.9 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  35.37 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  34.88 
 
 		 411 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  31.67 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.18 
 
 		 435 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  32.33 
 
 		 435 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  31.98 
 
 		 433 aa  186  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  32.78 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  29.93 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  29.93 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  32.45 
 
 		 409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  34.07 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  34.57 
 
 		 437 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  32.3 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  31.8 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  33.87 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  31.29 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  28.88 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  30.73 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  29.26 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>