More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4122 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4122  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 444 aa  848    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2831  sodium:dicarboxylate symporter  72.03 
 
 		 477 aa  538  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3163  sodium:dicarboxylate symporter  71.76 
 
 		 456 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  69.88 
 
 		 479 aa  532  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.02362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  65.38 
 
 		 500 aa  531  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3945  sodium:dicarboxylate symporter  67.91 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1322  sodium:dicarboxylate symporter  66.74 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1278  sodium:dicarboxylate symporter  66.28 
 
 		 476 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.421424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1315  sodium:dicarboxylate symporter  67.74 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28490  Na+/H+ dicarboxylate symporter  68.45 
 
 		 495 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1358  sodium:dicarboxylate symporter  66.51 
 
 		 435 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2338  sodium:dicarboxylate symporter  65.54 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276413  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16520  Na+/H+ dicarboxylate symporter  62.15 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3041  sodium:dicarboxylate symporter  57.66 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0982219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1660  sodium:dicarboxylate symporter  67.39 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2850  hypothetical protein  62.92 
 
 		 439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6394  sodium:dicarboxylate symporter  49.21 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  42.41 
 
 		 444 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  42.63 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  42.63 
 
 		 437 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  41.5 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  37.32 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  37.3 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  37.79 
 
 		 427 aa  239  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  38 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  38 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  38.44 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  38.41 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  38.41 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  37.76 
 
 		 419 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  33.49 
 
 		 442 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  38.17 
 
 		 417 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  37.76 
 
 		 419 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  37.91 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  37.47 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  38.01 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  37.47 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  37.47 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  36.78 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  34.51 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  37.15 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  35.05 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  38.58 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  39.12 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  40.16 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  35.01 
 
 		 437 aa  230  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  35.85 
 
 		 424 aa  229  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  35.6 
 
 		 444 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  33.26 
 
 		 457 aa  229  9e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  33.11 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  33.48 
 
 		 457 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  33.11 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  35.6 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  35.36 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  32.88 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  33.8 
 
 		 436 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  36.97 
 
 		 449 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  35.6 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  34.91 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  34.26 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  35.13 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  35.46 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  35.85 
 
 		 409 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  32.86 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  32.88 
 
 		 440 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  33.18 
 
 		 437 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  33.64 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 441 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.39 
 
 		 437 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  34.83 
 
 		 433 aa  216  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  34.16 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  33.71 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  31.22 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  34.93 
 
 		 402 aa  207  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  31.29 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  30.86 
 
 		 437 aa  206  9e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  33.73 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  35.35 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  34.86 
 
 		 448 aa  199  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  33.41 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  33.41 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.41 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  31.78 
 
 		 409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  33.41 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  32.26 
 
 		 447 aa  196  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.17 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  33.01 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  33.01 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  33.01 
 
 		 411 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  33.01 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  32.77 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  30.84 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  34.78 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  34.48 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  32.46 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  31.92 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>