More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28490 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28490  Na+/H+ dicarboxylate symporter  100 
 
 		 495 aa  969    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3945  sodium:dicarboxylate symporter  61.81 
 
 		 480 aa  518  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  63.47 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.02362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  62.82 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4122  sodium:dicarboxylate symporter  68.45 
 
 		 444 aa  508  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1322  sodium:dicarboxylate symporter  60.49 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2831  sodium:dicarboxylate symporter  65.35 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3163  sodium:dicarboxylate symporter  64.22 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1278  sodium:dicarboxylate symporter  60.04 
 
 		 476 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.421424  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16520  Na+/H+ dicarboxylate symporter  61.31 
 
 		 477 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2338  sodium:dicarboxylate symporter  64.42 
 
 		 439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276413  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1315  sodium:dicarboxylate symporter  58.97 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1358  sodium:dicarboxylate symporter  58.71 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3041  sodium:dicarboxylate symporter  56.04 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0982219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1660  sodium:dicarboxylate symporter  63.2 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2850  hypothetical protein  57.21 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6394  sodium:dicarboxylate symporter  47.14 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  40.32 
 
 		 444 aa  279  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  39.36 
 
 		 437 aa  276  9e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  39.36 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  39.59 
 
 		 439 aa  274  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  40.18 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  40.61 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  40.61 
 
 		 417 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  38.55 
 
 		 419 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  38.55 
 
 		 419 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  38.27 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  38.27 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  39.44 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  40.14 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  41.51 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  38.94 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  39.09 
 
 		 416 aa  247  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  39.91 
 
 		 416 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  36.2 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  35.63 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  37.87 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  35.98 
 
 		 444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  35.63 
 
 		 440 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  35.43 
 
 		 424 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  36.3 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  35.98 
 
 		 444 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  38 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  35.41 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  35.76 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  35.84 
 
 		 443 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  38.7 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  34.64 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  32.41 
 
 		 437 aa  226  8e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  35.22 
 
 		 409 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  32.74 
 
 		 449 aa  224  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  35.32 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  33.64 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  37.08 
 
 		 417 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  33.19 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  34.35 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  34.52 
 
 		 411 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  34.95 
 
 		 409 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  31.69 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.94 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  34.29 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  34.76 
 
 		 411 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  34.7 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.7 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  34.7 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  34.7 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  33.09 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  34.94 
 
 		 411 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  34.78 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  32.93 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  33.26 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  31.88 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  33.01 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  33.81 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  31.06 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  31.86 
 
 		 437 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  30 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  32.45 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  31.06 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  32.9 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  31.65 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  31.65 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  31.65 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  32.48 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  32.38 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  31.63 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.55 
 
 		 437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  31.54 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  31.63 
 
 		 437 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  29.64 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  32.45 
 
 		 441 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  31.73 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.02 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  31.65 
 
 		 440 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  33.02 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  31.85 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  31.32 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>