More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1315 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1315  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 435 aa  836    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1358  sodium:dicarboxylate symporter  92.41 
 
 		 435 aa  709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3041  sodium:dicarboxylate symporter  68.56 
 
 		 441 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0982219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4122  sodium:dicarboxylate symporter  67.74 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2850  hypothetical protein  66.59 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  60.43 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3163  sodium:dicarboxylate symporter  62.73 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2831  sodium:dicarboxylate symporter  65.31 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3945  sodium:dicarboxylate symporter  58.87 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1322  sodium:dicarboxylate symporter  58.33 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  59.29 
 
 		 479 aa  429  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.02362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1278  sodium:dicarboxylate symporter  59.09 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.421424  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28490  Na+/H+ dicarboxylate symporter  63.1 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2338  sodium:dicarboxylate symporter  61.2 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276413  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6394  sodium:dicarboxylate symporter  49.66 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16520  Na+/H+ dicarboxylate symporter  55.95 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1660  sodium:dicarboxylate symporter  61.58 
 
 		 454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  41.44 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  40.56 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  39.17 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  39.95 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  37.35 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  37.11 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  37.11 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  35.99 
 
 		 433 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  38.11 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  40.53 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  36.87 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 440 aa  264  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  37.06 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 417 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  36.17 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  37.92 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  37.19 
 
 		 409 aa  256  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  34.59 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  37.64 
 
 		 427 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  39.67 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 		 419 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 		 419 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 		 419 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  38.11 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  40.45 
 
 		 441 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  38.26 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  40.49 
 
 		 417 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  40.49 
 
 		 417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  40.54 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  37.89 
 
 		 426 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  39.53 
 
 		 416 aa  246  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  39.57 
 
 		 419 aa  246  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  37.57 
 
 		 410 aa  243  6e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  35.03 
 
 		 457 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  35.03 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  34.59 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  33.97 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.17 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  34.57 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  35.51 
 
 		 435 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  33.94 
 
 		 449 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  38.37 
 
 		 436 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  34.29 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.21 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  34.37 
 
 		 434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  33.73 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  31.91 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  33.98 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  32.72 
 
 		 439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  31.29 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  32.7 
 
 		 437 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  32.14 
 
 		 442 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  35.31 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  31.7 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  32.94 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 		 440 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  32.1 
 
 		 440 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  32.27 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.25 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  29.69 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  32.22 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  32.22 
 
 		 437 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  33.75 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  31.5 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  34.42 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.42 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  34.42 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  34.42 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  33.18 
 
 		 441 aa  203  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  33.75 
 
 		 411 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  33.5 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  33.42 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  33.5 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  32.68 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  34.86 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  31.43 
 
 		 423 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  31.89 
 
 		 424 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>