More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6394 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6394  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 446 aa  867    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3041  sodium:dicarboxylate symporter  51.7 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0982219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1315  sodium:dicarboxylate symporter  49.43 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2850  hypothetical protein  52.51 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1358  sodium:dicarboxylate symporter  51.33 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4122  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1322  sodium:dicarboxylate symporter  46.61 
 
 		 480 aa  329  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2831  sodium:dicarboxylate symporter  46.37 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  45.24 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1278  sodium:dicarboxylate symporter  45.55 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.421424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  46.88 
 
 		 479 aa  313  5.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.02362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16520  Na+/H+ dicarboxylate symporter  48.56 
 
 		 477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3163  sodium:dicarboxylate symporter  46.92 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3945  sodium:dicarboxylate symporter  45.08 
 
 		 480 aa  296  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2338  sodium:dicarboxylate symporter  44.8 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276413  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28490  Na+/H+ dicarboxylate symporter  47.74 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  39.08 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  38.7 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  39.31 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  39.31 
 
 		 437 aa  256  5e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  39.01 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  39.01 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  39.01 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  39.01 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  37.59 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  34.97 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  34.73 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  34.97 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  34.04 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1660  sodium:dicarboxylate symporter  42.51 
 
 		 454 aa  232  9e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  37.62 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  34.5 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  37.28 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  34.03 
 
 		 424 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  35.9 
 
 		 430 aa  230  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  36.92 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  34.62 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  33.8 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  33.8 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  35.02 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  35.11 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  37.44 
 
 		 441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  36.86 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  37.47 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  35.96 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  35.25 
 
 		 437 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  36.76 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  38.39 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  36.76 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  36.24 
 
 		 437 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  37.41 
 
 		 426 aa  223  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  38.39 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  37.86 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  36.53 
 
 		 442 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  36.5 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  34.78 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  35.26 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  36.92 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  36.48 
 
 		 416 aa  219  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  38.01 
 
 		 416 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  38.61 
 
 		 419 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  35.49 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  32.2 
 
 		 449 aa  217  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.48 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  35.48 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  34.96 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.79 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  35.73 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  36.79 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  35.38 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  35.23 
 
 		 410 aa  211  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  34.74 
 
 		 435 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.74 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  34.6 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  32.39 
 
 		 445 aa  206  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  33.41 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  33.87 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  33.58 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  33.41 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  34.6 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  35.61 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  32.44 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  32.92 
 
 		 409 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  34.86 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  32.21 
 
 		 457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  33.17 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  29.58 
 
 		 437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  34.72 
 
 		 438 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  32.94 
 
 		 432 aa  193  5e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  33 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  30.66 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  34.07 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  33.83 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  34.07 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.07 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.07 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  34.07 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  34.07 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  34.07 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  34.77 
 
 		 419 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>