176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0194 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 203 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.61 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  54.04 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.08 
 
 		 196 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  53.06 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  52.48 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  48.44 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  48.44 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  48.44 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  56.42 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  49.01 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  44.68 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  45.83 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.24 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  46.67 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.65 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.26 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  50.73 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  45.41 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  42.27 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  42.56 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  44.5 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  41.33 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  42.41 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  41.84 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2383  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.74 
 
 		 198 aa  140  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.52 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  41.33 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  40.82 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  40.82 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  42.64 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  40.82 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.82 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  41.33 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  43.37 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  38.78 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  44.1 
 
 		 212 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.54 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  48.7 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.2 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11850  lysine efflux permease  42.56 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00592861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  45.6 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.35 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  40.4 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  38.78 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  45.26 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  43.98 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  43.15 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  43.68 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  42.63 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.19 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  41.99 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  39.38 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  42.13 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.75 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4013  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.07 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.408071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  42.13 
 
 		 199 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  40.61 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  39.5 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  45.23 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.31 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  40.4 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  42.93 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.57 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.31 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  38.66 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  42.79 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  40 
 
 		 200 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  46.52 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  47.72 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3484  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.91 
 
 		 250 aa  118  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  40 
 
 		 205 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  45.83 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  44.95 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.91 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.103824  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  43.98 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1472  lysine exporter protein LysE/YggA  38.27 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  43.98 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  43.98 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  43.98 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  43.98 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  43.98 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00177  arginine exporter protein  33 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  40.4 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  40.4 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.15 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  40.4 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>