186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2143 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  92.08 
 
 		 202 aa  376  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  77 
 
 		 203 aa  316  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  73.27 
 
 		 202 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  65.35 
 
 		 203 aa  274  8e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  57.22 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  50.79 
 
 		 202 aa  197  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  51.78 
 
 		 209 aa  194  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  51.04 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  50.78 
 
 		 197 aa  191  9e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  52.58 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  43 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.77 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  46.46 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  52.57 
 
 		 204 aa  174  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.8 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.24 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  44.5 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.04 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  43.46 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  44.5 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  44.5 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  44.5 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.46 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  43.46 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  43.98 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  44.1 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.15 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  42.93 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  49.75 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  46.5 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  43.08 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.04 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  43.46 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  44.9 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  43.08 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  46.67 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  48.11 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  48.44 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  47.21 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  42.86 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.99 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.85 
 
 		 196 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  41.62 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  44 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  45.69 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  42.35 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  41.84 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.67 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  42.35 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.36 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  42.35 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  41.33 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  45.73 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  45.23 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  42.49 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  46.49 
 
 		 199 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  46.49 
 
 		 199 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  46.49 
 
 		 199 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  43.43 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  46.46 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.11 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  44.72 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  47.72 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  40.1 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  40.1 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  40.1 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 276 aa  145  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  40.31 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.29 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  45.23 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.25 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  45.69 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.69 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  41.84 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  41.12 
 
 		 211 aa  140  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  41.33 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  41.33 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  41.33 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  48.73 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  38.07 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  44.9 
 
 		 200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  40.1 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  40.1 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  40.1 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2383  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.52 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  40.1 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  40.1 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.8 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  44.39 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  40.86 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  43.68 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  43.68 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  45.03 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.57 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  43.68 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>