174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1472 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1472  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 210 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  48.5 
 
 		 209 aa  201  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  50.26 
 
 		 194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  48.74 
 
 		 211 aa  187  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  48.7 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  48.7 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  48.7 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  48.7 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  47.96 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  48.7 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  48.7 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  48.7 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  48.7 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  48.7 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4136  amino acid transporter LysE  45.54 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  44.27 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  46.94 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  46.43 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  46.43 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  46.43 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1011  lysine exporter protein LysE/YggA  45.18 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.591739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.74 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  44.67 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  43.01 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  37.76 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  44.56 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  43.52 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  43.52 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 		 199 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  37.38 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  37.76 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 199 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.57 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.15 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1338  lysine exporter protein LysE/YggA  42.64 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  44.04 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  38.78 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  34.55 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  41.15 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  41.95 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  39.38 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  38.42 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.2 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.18 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  39.27 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  40.53 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  36.27 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 197 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.46 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.63 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  35.71 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.87 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  40 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  39.8 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.23 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.11 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2432  lysine exporter protein LysE/YggA  40.3 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  40.2 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26510  Lysine exporter protein  37.56 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.98 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.55 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  37.31 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  39.89 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  42.94 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 		 204 aa  124  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  37.24 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  37.44 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  32.99 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  36.68 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  39.8 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 216 aa  121  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.06 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  34.03 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 213 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.06 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>