172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1011 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1011  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.591739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4136  amino acid transporter LysE  54.85 
 
 		 206 aa  242  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  47.34 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  44.76 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  44.04 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1472  lysine exporter protein LysE/YggA  45.18 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  42.86 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  42.86 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  42.86 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  42.86 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  44.79 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  44.44 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  44.79 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  44.79 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  44.27 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.74 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  43.92 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  42.19 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  42.33 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  42.33 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  42.33 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  42.33 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  42.33 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  42.33 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  41.67 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  37.95 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  36.92 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 199 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  37.04 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  42.19 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  42.19 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  34.01 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.9 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  34.85 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  37.95 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 203 aa  121  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  38.05 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  37.11 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  33.68 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  35.42 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  35.71 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  32.32 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.6 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.16 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  32.16 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  31.82 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  33.67 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  29.23 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  33.67 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.82 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1338  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  32.99 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  36.65 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.15 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00177  arginine exporter protein  33.53 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  35.57 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.08 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  31.43 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.77 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  36.65 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  34.92 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2432  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.88 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  31.84 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  35.75 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.39 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.35 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  37.11 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  35.75 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11850  lysine efflux permease  31.66 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00592861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.5 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2966  hypothetical protein  29.74 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  29.23 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.16 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>