220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  100 
 
 		 200 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  93 
 
 		 200 aa  323  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  76.38 
 
 		 204 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  76.38 
 
 		 199 aa  295  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  75.88 
 
 		 199 aa  294  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  73.6 
 
 		 200 aa  292  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  73.1 
 
 		 200 aa  292  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  76.26 
 
 		 199 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  72.59 
 
 		 200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  79.23 
 
 		 200 aa  241  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1338  lysine exporter protein LysE/YggA  48.98 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  47.24 
 
 		 205 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  48.72 
 
 		 206 aa  177  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  50.51 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2432  lysine exporter protein LysE/YggA  52.55 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.5 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  47.8 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.19 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  45.55 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  52.76 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.31 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  46.19 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  43.94 
 
 		 211 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  43.94 
 
 		 211 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.19 
 
 		 196 aa  160  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  43.94 
 
 		 211 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  44.85 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.81 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.39 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  42.64 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  47.21 
 
 		 203 aa  158  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  50.76 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.59 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.72 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  46.53 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  52.79 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  43.72 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  47.74 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  47.74 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  48.22 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  41.62 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  50.52 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  42.27 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  45.64 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.94 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  43.88 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  46.46 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  43.59 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  47.94 
 
 		 216 aa  151  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  46.46 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 206 aa  150  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  45.96 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  45.96 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  45.96 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  45.6 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  42.5 
 
 		 204 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  44.95 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  44.95 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  48.69 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  44.95 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  44.95 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  44.95 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.96 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  39.9 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  41.5 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  47.42 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  50.25 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.26 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  45.64 
 
 		 202 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  41.5 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  42.29 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  46.46 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.34 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  43 
 
 		 206 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.86 
 
 		 202 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  44.55 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  42.5 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  48.9 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  42.5 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  42.5 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  42.5 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  42.5 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  42.5 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  42.5 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4035  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  49.21 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.7 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  46.7 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  47.74 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>