175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3140 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  96.6 
 
 
206 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  96.6 
 
 
206 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  96.6 
 
 
206 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  96.6 
 
 
206 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  96.6 
 
 
206 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  96.6 
 
 
206 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  86.89 
 
 
206 aa  359  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  86.41 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  86.41 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  86.41 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  86.41 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  86.41 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  86.41 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  85.92 
 
 
206 aa  354  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  82.04 
 
 
205 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  80.19 
 
 
205 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  79.21 
 
 
204 aa  321  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.76 
 
 
219 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  50.51 
 
 
208 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  47.76 
 
 
219 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  50.76 
 
 
209 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  50 
 
 
205 aa  155  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.26 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  48.95 
 
 
196 aa  154  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.37 
 
 
211 aa  154  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.66 
 
 
227 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  46.7 
 
 
210 aa  153  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.19 
 
 
213 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  46.23 
 
 
212 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  43.78 
 
 
200 aa  151  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  46.91 
 
 
216 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  49.72 
 
 
204 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  46.24 
 
 
204 aa  148  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.08 
 
 
276 aa  148  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.01 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  43.01 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  50.54 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  46.15 
 
 
202 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  48.45 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  41.94 
 
 
206 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  42.55 
 
 
204 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.17 
 
 
208 aa  145  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  41.94 
 
 
204 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  41.45 
 
 
197 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  43.94 
 
 
200 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.33 
 
 
209 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  41.4 
 
 
213 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  41.09 
 
 
215 aa  143  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  49.47 
 
 
209 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.92 
 
 
206 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  47 
 
 
216 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  44.79 
 
 
202 aa  141  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 
204 aa  141  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.74 
 
 
210 aa  141  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.27 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  42.93 
 
 
216 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  48.77 
 
 
208 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  44.62 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  41 
 
 
205 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.46 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.16 
 
 
211 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  40.89 
 
 
200 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  45.6 
 
 
199 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 
200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  45 
 
 
220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.38 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.09 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4035  lysine exporter protein LysE/YggA  42.13 
 
 
214 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94524  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  45.08 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  42.44 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.68 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  42.78 
 
 
202 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  44.83 
 
 
200 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.15 
 
 
205 aa  131  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  38.27 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  46.43 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  40.89 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
200 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  43.55 
 
 
217 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0896  lysine exporter protein LysE/YggA  43.78 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  41.94 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.02 
 
 
195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  43.15 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  43 
 
 
200 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  37.76 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  37.76 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  37.76 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  40.5 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  41 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  41 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  40.89 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0455  lysine exporter protein LysE/YggA  43.09 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0934  lysine exporter protein LysE/YggA  43.09 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.103824  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  41.29 
 
 
211 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>