204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3686 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  100 
 
 		 204 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  94.61 
 
 		 204 aa  332  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  74.75 
 
 		 211 aa  300  8.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  74.75 
 
 		 211 aa  300  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  74.75 
 
 		 211 aa  300  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  74.75 
 
 		 211 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  70.65 
 
 		 204 aa  292  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  76.73 
 
 		 211 aa  290  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  76.73 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  76.73 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  77.72 
 
 		 205 aa  289  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  76.24 
 
 		 211 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  76.24 
 
 		 211 aa  287  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  76.24 
 
 		 211 aa  287  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  76.24 
 
 		 211 aa  287  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  76.24 
 
 		 211 aa  287  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  76.24 
 
 		 211 aa  287  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  73.76 
 
 		 211 aa  281  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  69.8 
 
 		 205 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  69.95 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  69.95 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  51.26 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  48.4 
 
 		 194 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  47.24 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  43.5 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  42.5 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.39 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1011  lysine exporter protein LysE/YggA  43.92 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.591739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  44.72 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4136  amino acid transporter LysE  41.67 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  41.92 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1472  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  42.35 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  41.62 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  41.33 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  41.33 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.33 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  41.33 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  40.82 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  41.33 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.22 
 
 		 205 aa  147  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  41.12 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.09 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  46.46 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  38.22 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  46.46 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  38.46 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  42.5 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  41.62 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  42 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  44.22 
 
 		 216 aa  140  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  42 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  42 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  42 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  42 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  42 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  42 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.47 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  38.66 
 
 		 214 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  41 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  44.56 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.33 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  41.29 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  39.2 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  45.98 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 		 196 aa  131  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.55 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.71 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  42.71 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  38.58 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.89 
 
 		 205 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  43.3 
 
 		 205 aa  127  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  40.43 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  36.6 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1338  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  35.83 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  38.95 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3529  lysine exporter protein LysE/YggA  37.95 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0248558  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  45.95 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  42.71 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  39.36 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>