228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0982 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 199 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  96.98 
 
 		 204 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  97.49 
 
 		 199 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  96.98 
 
 		 199 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  85.35 
 
 		 200 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  83.76 
 
 		 200 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  83.25 
 
 		 200 aa  327  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  76.26 
 
 		 200 aa  254  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  75.25 
 
 		 200 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  79.8 
 
 		 200 aa  248  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  51.79 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.01 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1338  lysine exporter protein LysE/YggA  50.51 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  53.33 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.26 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  45.23 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  45.18 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  46.19 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  42.71 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 		 205 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.82 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  44.95 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.71 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  52.58 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  47.18 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  42.21 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  44.79 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  52.31 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  41.21 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  51.28 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.59 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  42.78 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  45.13 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  43.43 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.73 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  49.25 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  43.96 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  43.3 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  43.94 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  43.94 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  43.94 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2432  lysine exporter protein LysE/YggA  48.24 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.79 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.35 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.31 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  50.26 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  45.79 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  43.81 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  48.21 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.88 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  44.72 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  44.33 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.24 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  40.7 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  47.12 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  47.42 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  47.8 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  44.56 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  47.96 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.33 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  46.19 
 
 		 199 aa  143  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.34 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  43.59 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  44.04 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  47.64 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.84 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  40.1 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  46.88 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  44.85 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  42.78 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.96 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  42.78 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  47.96 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  45.13 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  44.72 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  44.62 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  43.22 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  43.22 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  43.22 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  43.22 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  44.62 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  43.22 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  44.62 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4136  amino acid transporter LysE  37.44 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  44.62 
 
 		 201 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.22 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  38.17 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1472  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  50.51 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  38.97 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  45.77 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  41.58 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  45.41 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>