188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10496 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  100 
 
 
201 aa  390  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  63.44 
 
 
199 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  56.68 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  59.14 
 
 
202 aa  205  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  61.96 
 
 
199 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  61.96 
 
 
199 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  61.96 
 
 
199 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.45 
 
 
227 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  50.27 
 
 
205 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.21 
 
 
217 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.64 
 
 
208 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.54 
 
 
196 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  45.99 
 
 
202 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  50.27 
 
 
209 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  48.65 
 
 
210 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  45.83 
 
 
203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.74 
 
 
210 aa  154  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  51.19 
 
 
204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  48.13 
 
 
212 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50 
 
 
219 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  44.81 
 
 
202 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  46.77 
 
 
201 aa  148  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  48.63 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  44.62 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.49 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  49.73 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  45.05 
 
 
212 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  46.15 
 
 
220 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  46.89 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.63 
 
 
195 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  43.78 
 
 
200 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  48.35 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  43.55 
 
 
205 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  43.55 
 
 
205 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.55 
 
 
205 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  43.55 
 
 
205 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  44.62 
 
 
204 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  44.09 
 
 
204 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.94 
 
 
202 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  44.09 
 
 
206 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  44.97 
 
 
204 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 
213 aa  140  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  43.58 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  40 
 
 
215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  44.09 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  48.33 
 
 
200 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.39 
 
 
201 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  46.67 
 
 
204 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  47.46 
 
 
204 aa  138  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  46.67 
 
 
199 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  46.67 
 
 
199 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  44.62 
 
 
199 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  40.22 
 
 
197 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.96 
 
 
213 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  41.4 
 
 
216 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  51.7 
 
 
199 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  51.93 
 
 
209 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  42.47 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  43.09 
 
 
206 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.86 
 
 
202 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2383  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.65 
 
 
198 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  46.11 
 
 
200 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  46.11 
 
 
200 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.72 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  51.38 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  41.94 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.86 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  41.76 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  45.11 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3484  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.17 
 
 
250 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  48.55 
 
 
217 aa  131  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  46.6 
 
 
212 aa  131  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.41 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  43.41 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  43.46 
 
 
206 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.44 
 
 
205 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 
206 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.56 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  43.46 
 
 
206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.21 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  44.92 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  44.21 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  42.41 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  42.41 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  42.41 
 
 
206 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  45.65 
 
 
200 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.92 
 
 
203 aa  124  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  42.63 
 
 
204 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.13 
 
 
211 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  41.88 
 
 
206 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  45.3 
 
 
219 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.68 
 
 
205 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  45.83 
 
 
200 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  43.65 
 
 
216 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  42.93 
 
 
206 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  42.7 
 
 
205 aa  121  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  42.41 
 
 
206 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.94 
 
 
209 aa  121  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  42.41 
 
 
206 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>