173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4136 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4136  amino acid transporter LysE  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1011  lysine exporter protein LysE/YggA  54.85 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.591739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  46.38 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  47.59 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  43.07 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1472  lysine exporter protein LysE/YggA  45.54 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  41.41 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  39.49 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  43.75 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  43.75 
 
 		 211 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  43.75 
 
 		 211 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  42.63 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  43.23 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  42.63 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  42.63 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  42.63 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  41.24 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  41.15 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  41.27 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  41.27 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  41.67 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  41.27 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  41.27 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  41.27 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  38.62 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.82 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  37.04 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  41.15 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  40.91 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  40.91 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  35.23 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  38.19 
 
 		 216 aa  124  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.46 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  35.45 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  36.79 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 		 203 aa  117  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  33.84 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.85 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  37.95 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.39 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  33.16 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  34.87 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  34.72 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  34.2 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  33.33 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  31.12 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  34.52 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.98 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  32.58 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1338  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  32.99 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.66 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.63 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  39.57 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  40.11 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.82 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  33.16 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2966  hypothetical protein  34.5 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  34 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>