171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3100 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  100 
 
 		 201 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.76 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  57.73 
 
 		 202 aa  234  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.22 
 
 		 202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  58 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  56.41 
 
 		 203 aa  221  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  55.84 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  54.4 
 
 		 202 aa  197  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  51.05 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  55.98 
 
 		 208 aa  187  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  54.31 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  47.21 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.75 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  54.68 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  47 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  47.24 
 
 		 208 aa  174  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  45.73 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  48.76 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  45.23 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  49.47 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  45.23 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  52.53 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.04 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.15 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  46 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  46 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  52.79 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  46 
 
 		 213 aa  167  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  45.5 
 
 		 205 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  51.32 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.21 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  46.04 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  50.86 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  46.77 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  46 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  55.17 
 
 		 204 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.27 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  51.56 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.87 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  47.89 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  47.89 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  47.89 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  48.17 
 
 		 200 aa  157  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.41 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.53 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.94 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  47.69 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  44.95 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  44.33 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  45.13 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  46.34 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  42.64 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.54 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  41.87 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  45.77 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  49.01 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  45.54 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  49.21 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.68 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  45.77 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  44.78 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  44.78 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.46 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26510  Lysine exporter protein  44.17 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250638  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  49.5 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.96 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.95 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.103824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.73 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1338  lysine exporter protein LysE/YggA  41.54 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.74 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.85 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  47.85 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  43.94 
 
 		 200 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  46.57 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  44.1 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.75 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  43.75 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  41.79 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  45.1 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.69 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  44.21 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2383  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.77 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  44.02 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  43.52 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3484  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 		 250 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  44.02 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  45.9 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.8 
 
 		 205 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  38.81 
 
 		 211 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  43.33 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  42.56 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  40.72 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  38.31 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  38.31 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  38.31 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>