184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1506 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  94.15 
 
 		 205 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  83.33 
 
 		 204 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  81.16 
 
 		 206 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  80.19 
 
 		 206 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  80.68 
 
 		 206 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  80.68 
 
 		 206 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  79.13 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  80.19 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  79.13 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  79.13 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  79.13 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  79.13 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  79.13 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  79.71 
 
 		 206 aa  324  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  80.19 
 
 		 206 aa  324  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  78.64 
 
 		 206 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  78.64 
 
 		 206 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.08 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  50.76 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.44 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.47 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  51.27 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  48.73 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  48.95 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  49.24 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  47.15 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  41.79 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  46.67 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  44.04 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.87 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  44.5 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.5 
 
 		 276 aa  147  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  48.26 
 
 		 204 aa  147  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  45.13 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.67 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  44.74 
 
 		 199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.16 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  42.16 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.04 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  46.7 
 
 		 216 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  46.15 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.28 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  42.7 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  48.45 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.16 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  42.16 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  42.16 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  41.4 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  46.15 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.92 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  41.62 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  41.62 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  39 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  41.95 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  45.21 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  41.08 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.81 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  45.18 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  46.46 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  51.08 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.8 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4035  lysine exporter protein LysE/YggA  41.5 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  46.19 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.33 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  41.08 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.88 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.8 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  40.69 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  41.18 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  40.4 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  41.75 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  40.72 
 
 		 206 aa  130  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  41.26 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.43 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  41.58 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  45.21 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26510  Lysine exporter protein  40.3 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.03 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.103824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  38.83 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  44.92 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.12 
 
 		 205 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  44.92 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  44.92 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  38 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  44.68 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  41.12 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  36.5 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  39.46 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  40 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  42 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  38.5 
 
 		 211 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0934  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  38.5 
 
 		 211 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>