210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1789 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  99.51 
 
 
205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  99.02 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  90.69 
 
 
206 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  91.18 
 
 
204 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  91.18 
 
 
204 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  90.69 
 
 
204 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  89.22 
 
 
213 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  73.5 
 
 
214 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  71.92 
 
 
204 aa  298  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  71.29 
 
 
208 aa  298  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  73 
 
 
202 aa  294  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  72.5 
 
 
203 aa  291  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  46.27 
 
 
206 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.96 
 
 
209 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  46.6 
 
 
212 aa  185  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  49.75 
 
 
216 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  45.13 
 
 
202 aa  177  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  47.92 
 
 
203 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  46.73 
 
 
215 aa  175  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  44.28 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  48.5 
 
 
209 aa  171  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  45.31 
 
 
203 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  47.72 
 
 
205 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.46 
 
 
202 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  46.5 
 
 
202 aa  167  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  43.22 
 
 
199 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  47.94 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 
199 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  41.71 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44 
 
 
201 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.55 
 
 
202 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  46.6 
 
 
204 aa  160  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 
200 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  41.71 
 
 
200 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 
197 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.72 
 
 
208 aa  156  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.85 
 
 
205 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  45.98 
 
 
204 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.4 
 
 
211 aa  154  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  40.7 
 
 
200 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.85 
 
 
213 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  46.6 
 
 
204 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.55 
 
 
217 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  42.49 
 
 
208 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  40.62 
 
 
209 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  43.55 
 
 
206 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  45.21 
 
 
202 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  46 
 
 
201 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  43.55 
 
 
206 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  43.08 
 
 
196 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.81 
 
 
211 aa  148  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  41.92 
 
 
216 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  43.15 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  43.65 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.63 
 
 
206 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  42.47 
 
 
206 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.87 
 
 
213 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.01 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  42.78 
 
 
204 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 
206 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  39.8 
 
 
211 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.08 
 
 
210 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  43.98 
 
 
203 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  42.47 
 
 
206 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  42.47 
 
 
206 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  46.7 
 
 
199 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 
204 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.35 
 
 
219 aa  143  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  42.35 
 
 
211 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00177  arginine exporter protein  39.46 
 
 
200 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  43.55 
 
 
201 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  39.29 
 
 
211 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  39.29 
 
 
211 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  43.82 
 
 
199 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  39.29 
 
 
211 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  42.16 
 
 
205 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  43.85 
 
 
206 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.16 
 
 
205 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  41.33 
 
 
204 aa  140  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  43.46 
 
 
200 aa  140  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  43.32 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  39.04 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  41.33 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  43.32 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  43.32 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  43.32 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  43.32 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  43.32 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  40.96 
 
 
200 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  37 
 
 
207 aa  139  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  40.31 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  40.31 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  40.31 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  40.31 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  40.31 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  40.31 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>