210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1653 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  99.02 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  98.04 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  97.06 
 
 		 206 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  90.69 
 
 		 205 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  90.69 
 
 		 205 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  90.2 
 
 		 205 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  89.71 
 
 		 205 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  90.2 
 
 		 213 aa  370  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  75.5 
 
 		 214 aa  307  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  72.77 
 
 		 208 aa  304  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  72.91 
 
 		 204 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  73.5 
 
 		 202 aa  297  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  72.5 
 
 		 203 aa  293  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  47.69 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.45 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  51.03 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  48.45 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  47.12 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  45.5 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  50.76 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  46.73 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  47.4 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  46.94 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.5 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  48.17 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  44.22 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  43.22 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  42.71 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.62 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  46.39 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  47.64 
 
 		 204 aa  161  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  46.19 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.01 
 
 		 211 aa  160  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  42.56 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  42.78 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  42.56 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.9 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  47.64 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.92 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.33 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  42.71 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  47 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.55 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.5 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.33 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  44.83 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.81 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  44.16 
 
 		 196 aa  147  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  42.56 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.44 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  43.01 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  42.78 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  43.52 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  44.56 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  45.51 
 
 		 199 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  44.9 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  42.25 
 
 		 206 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  47.45 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  42.25 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  43.78 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  43.78 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  42.25 
 
 		 204 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  43.41 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  43.78 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  38 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  44.97 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.06 
 
 		 204 aa  141  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  41.4 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  40.51 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  41.33 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  38.78 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  42.78 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  40.31 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  41.4 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  41.4 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  40.31 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  38.5 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  42.25 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  41.18 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  38.27 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  38.27 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  42.25 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  42.25 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  42.25 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  42.25 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  42.25 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  38.27 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.86 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  42.47 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  39.8 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.08 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.71 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  45.3 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>