178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5006 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  99.51 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  96.6 
 
 		 206 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  95.15 
 
 		 206 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  95.15 
 
 		 206 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  95.15 
 
 		 206 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  95.15 
 
 		 206 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  87.38 
 
 		 206 aa  359  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  86.89 
 
 		 206 aa  357  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  86.89 
 
 		 206 aa  357  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  86.89 
 
 		 206 aa  357  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  86.89 
 
 		 206 aa  357  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  86.89 
 
 		 206 aa  357  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  86.89 
 
 		 206 aa  357  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  86.41 
 
 		 206 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  81.55 
 
 		 205 aa  332  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  79.71 
 
 		 205 aa  324  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  78.22 
 
 		 204 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.76 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 196 aa  158  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  47.26 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  48.47 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  48.22 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  48.97 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  45.69 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.13 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  43.28 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  50 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.32 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.26 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  47.98 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  44.44 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  46.39 
 
 		 216 aa  150  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.15 
 
 		 213 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.18 
 
 		 276 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.55 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  50.54 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  43.55 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  43.55 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  43.55 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  46.15 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  42.47 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  43.09 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  42.47 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  43.55 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.72 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  41.94 
 
 		 213 aa  144  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.33 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  47.94 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  42.25 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.45 
 
 		 206 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  40.3 
 
 		 215 aa  142  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  43.43 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.75 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  46.5 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  49.47 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  41 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  45.16 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  49.73 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.74 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.15 
 
 		 196 aa  137  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.5 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.38 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  41.88 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  44.15 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.63 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.03 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  44.56 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  40.39 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  39.2 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  47.45 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  42.44 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  41.97 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  40.89 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  38.27 
 
 		 211 aa  131  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.15 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  41.94 
 
 		 203 aa  131  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4035  lysine exporter protein LysE/YggA  40.3 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  43.01 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  43.84 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  39.8 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  37.76 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  37.76 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  37.76 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  39.41 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  40.5 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  40.5 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  40.5 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  43.46 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.64 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  42 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  43.65 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  44.62 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  44.62 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  44.62 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  40 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  38.78 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>