180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3862 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  100 
 
 		 216 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  77.36 
 
 		 216 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  73.66 
 
 		 219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  76.24 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  74.07 
 
 		 213 aa  270  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  69.35 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  62.63 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  60.78 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  60.1 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  52.55 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  52.68 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  53.33 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  52.79 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  50.78 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  49.74 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  50.26 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.62 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  53.57 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  50.97 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  53.33 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.46 
 
 		 211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  48.22 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.29 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.79 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  51.22 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  48.97 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  47.4 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.74 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  45.92 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  48.97 
 
 		 206 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  47.94 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  47.94 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  45.92 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  47.94 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  47 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  46.91 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  46.91 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  46.39 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  46.39 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  48.45 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  43.88 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.05 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  43.08 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  46.91 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.22 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  49.22 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  46.91 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  46.91 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  46.91 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  46.91 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  46.91 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  46.31 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  46.77 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  46.91 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  42.56 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  42.56 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 205 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.92 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.88 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.23 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  48 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  42.56 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  45.92 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  40.29 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.24 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  47.5 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  49.74 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  50.77 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.72 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  52.13 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  46.97 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.35 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  46.07 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.5 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  48 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  48.94 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  45.7 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.85 
 
 		 196 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  42 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  46.46 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.6 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  48.53 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  50.76 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  49.23 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  46.91 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11850  lysine efflux permease  43.22 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00592861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  48.85 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  45.11 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.91 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  45.27 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1338  lysine exporter protein LysE/YggA  43.63 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  45.9 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  39.68 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.75 
 
 		 276 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>