173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0035 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  99.51 
 
 
206 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  97.09 
 
 
206 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  86.89 
 
 
206 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  87.38 
 
 
206 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  86.89 
 
 
206 aa  357  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  86.41 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  86.41 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  86.41 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  86.41 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  83.17 
 
 
204 aa  333  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  80.58 
 
 
205 aa  329  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  79.13 
 
 
205 aa  325  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  50.74 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  51.47 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.15 
 
 
219 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  47.76 
 
 
219 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.89 
 
 
211 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  50.54 
 
 
204 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  47.72 
 
 
210 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.56 
 
 
227 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.18 
 
 
276 aa  152  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  49.74 
 
 
196 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.09 
 
 
213 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  48.72 
 
 
205 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  46.39 
 
 
216 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  44.09 
 
 
208 aa  148  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  50.54 
 
 
204 aa  148  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  45.95 
 
 
204 aa  147  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  46.67 
 
 
202 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.27 
 
 
213 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  42.08 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.55 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.17 
 
 
208 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  46.73 
 
 
216 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  40.82 
 
 
205 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  46.77 
 
 
202 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  49.47 
 
 
209 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  49.73 
 
 
212 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  40.3 
 
 
215 aa  141  7e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  43.68 
 
 
212 aa  141  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  42.47 
 
 
205 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.94 
 
 
206 aa  141  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.32 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  43.32 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  43.32 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  41.94 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  41.94 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  41.27 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  45.31 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  41.94 
 
 
204 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  41.94 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  42.25 
 
 
204 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4035  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 
214 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94524  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  43.23 
 
 
200 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  41.38 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.97 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.7 
 
 
201 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  43.01 
 
 
202 aa  134  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.68 
 
 
202 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  42.51 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  50.27 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  44.5 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.46 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 
204 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  40.5 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  46.7 
 
 
212 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.78 
 
 
196 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.76 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  41.97 
 
 
202 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  41.97 
 
 
203 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  46 
 
 
203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  49.16 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  49.16 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  49.16 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  40.82 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3519  putative transmembrane protein  43.55 
 
 
217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376763  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  40.82 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.72 
 
 
195 aa  127  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  39.41 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  46.56 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  42 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.93 
 
 
205 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  37.24 
 
 
211 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0896  lysine exporter protein LysE/YggA  43.78 
 
 
208 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 
203 aa  124  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  41.79 
 
 
216 aa  124  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  39.5 
 
 
211 aa  124  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 
199 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0455  lysine exporter protein LysE/YggA  42.39 
 
 
208 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0934  lysine exporter protein LysE/YggA  42.39 
 
 
208 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  43.35 
 
 
200 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  41.24 
 
 
220 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  42.27 
 
 
219 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>