166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0159 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 276 aa  541  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.84 
 
 		 208 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  43.85 
 
 		 200 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  41.57 
 
 		 203 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  43.41 
 
 		 208 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  43.37 
 
 		 205 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  42.4 
 
 		 209 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.72 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.22 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  42.54 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3484  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.71 
 
 		 250 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.11 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  41.88 
 
 		 204 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.54 
 
 		 219 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  42.35 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  41.7 
 
 		 203 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  39.6 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  37.4 
 
 		 202 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  36.29 
 
 		 202 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.21 
 
 		 196 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  38.28 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  39.02 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  39.08 
 
 		 206 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  37.5 
 
 		 212 aa  148  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  39.5 
 
 		 205 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.5 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 		 206 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  40.76 
 
 		 206 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1830  lysine exporter protein LysE/YggA  39.08 
 
 		 204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  38.66 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  38.24 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 		 206 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.25 
 
 		 202 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1176  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.91 
 
 		 206 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 		 214 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  38.59 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  38.59 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  38.59 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  38.59 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  38.59 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  38.59 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  40.17 
 
 		 206 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  38.17 
 
 		 206 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  36.47 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 		 196 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  34.94 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  37.6 
 
 		 204 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.57 
 
 		 211 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  35.06 
 
 		 202 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  33.07 
 
 		 204 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.08 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.57 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  36.33 
 
 		 215 aa  136  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 		 204 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  33.07 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  33.33 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 206 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  33.07 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.61 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  37.96 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  35.06 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  35.95 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.81 
 
 		 205 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 205 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.84 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11850  lysine efflux permease  36.65 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00592861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22010  lysine efflux permease  36.96 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 		 201 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  37.7 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  36.55 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  33.86 
 
 		 204 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 		 199 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 		 199 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2508  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.96 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3161  lysine exporter protein LysE/YggA  38.06 
 
 		 219 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  38.59 
 
 		 199 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77034  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  36.74 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2837  lysine exporter protein LysE/YggA  36.4 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.224283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  33.2 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1574  lysine exporter protein LysE/YggA  36.03 
 
 		 220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.91 
 
 		 195 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.29 
 
 		 207 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  33.6 
 
 		 200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  30.24 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  28.35 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  30.59 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4492  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.885148 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  28.52 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3698  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 211 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  34.85 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>